Análise Filogenética Bayesiana — Inferência de Árvores Evolutivas Baseada em MCMC

A análise filogenética bayesiana utiliza o teorema de Bayes e a amostragem de Monte Carlo via Cadeias de Markov (MCMC) para estimar a distribuição de probabilidade a posteriori sobre árvores filogenéticas e parâmetros do modelo, dados os dados de sequência observados. Diferentemente dos métodos de máxima verossimilhança com bootstrap, que retornam uma única árvore ótima, a inferência bayesiana gera um conjunto credível de árvores com probabilidades a posteriori associadas, fornecendo uma medida principiada da incerteza filogenética. É o quadro dominante para estimar tempos de divergência e relações ancestrais na evolução molecular.