Różnicowa analiza danych RNA-seq z pojedynczych komórek

Różnicowa analiza danych RNA-seq z pojedynczych komórek (scRNA-seq) to potok obliczeniowy, który porównuje profile transkryptomiczne w różnych warunkach biologicznych — takich jak traktowane versus nietraktowane, choroba versus zdrowie, lub punkty czasowe — z rozdzielczością pojedynczej komórki. Identyfikuje, które geny, typy komórek i stany komórek zmieniają się między warunkami, dostarczając mechanistycznych wglądów, których nie mogą zaoferować porównania zbiorczego RNA-seq. Podejście to łączy klasteryzację, adnotację typów komórek i testowanie statystyczne, zazwyczaj wykorzystując pseudozbiorczą agregację w celu uwzględnienia korelacji wewnątrzpróbkowej.