Różnicowa analiza zmienności liczby kopii — Porównawcza analiza CNV / SCNA
Różnicowa analiza zmienności liczby kopii (dCNV) identyfikuje regiony genomu, w których liczba kopii DNA systematycznie różni się między dwoma warunkami — takimi jak tkanka nowotworowa a normalna, kohorty przypadków a kontrolne, lub komórki leczone a nieleczone. Łącząc dane dotyczące głębokości odczytu na poziomie sondy lub intensywności macierzy z segmentacją statystyczną i testowaniem na poziomie grupy, precyzyjnie określa somatyczne amplifikacje i delecje, które mogą napędzać chorobę, oraz odróżnia nawracające zdarzenia napędzające od szumu pasażerskiego w całej kohorcie.
Przeczytaj pełny opis metody
Zaloguj się na bezpłatne konto, aby przeczytać tę sekcję.
Mapa metod
Sąsiedztwo pokrewnych metod — wybierz węzeł, aby je zgłębić.
Źródła
- Olshen, A. B., Venkatraman, E. S., Lucito, R., & Wigler, M. (2004). Circular binary segmentation for the analysis of array-based DNA copy number data. Biostatistics, 5(4), 557–572. DOI: 10.1093/biostatistics/kxh008 ↗
- Mermel, C. H., Schumacher, S. E., Hill, B., Meyerson, M. L., Beroukhim, R., & Getz, G. (2011). GISTIC2.0 facilitates sensitive and confident localization of the targets of focal somatic copy-number alteration in human cancers. Genome Biology, 12(4), R41. DOI: 10.1186/gb-2011-12-4-r41 ↗
Jak cytować tę stronę
ScholarGate. (2026, June 3). Differential Copy Number Variation Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/pl/bioinformatics/differential-copy-number-variation-analysis
Która metoda?
Zestaw tę metodę z najbliższymi jej krewnymi i czytaj je obok siebie — biblioteka kładzie księgi na stole; wybór należy do Ciebie.
- Badanie asocjacyjne całego genomu (GWAS)Bioinformatyka↔ porównaj
Widzisz błąd na tej stronie? Zgłoś go lub zaproponuj poprawkę →