GCTA

Persoalan utama yang ditangani oleh GCTA ialah: sejauh manakah variasi dalam sesuatu ciri (cth., ketinggian atau risiko penyakit) dalam kalangan individu disebabkan oleh perbezaan genetik berbanding faktor persekitaran? Kajian kembar dan keluarga telah lama menangani perkara ini, tetapi ia mengelirukan kesan gen yang dikongsi dan persekitaran yang dikongsi. GCTA berfungsi secara berbeza. Ia menggunakan data SNP seluruh genom untuk mengukur kesamaan genetik antara individu yang tidak berkaitan pada ribuan lokus secara serentak. Ia kemudian bertanya: adakah individu yang lebih serupa secara genetik juga mempunyai nilai ciri yang lebih serupa? Jika ya, ini menunjukkan pengaruh genetik. GREML menganggar kewarisan dengan membandingkan persamaan ciri yang diperhatikan dalam kalangan individu dengan perkaitan genetik seluruh genom mereka, yang dikira daripada SNP. Pendekatan ini berkuasa kerana ia menggunakan ratusan ribu varian lazim, yang merangkumi kesan kumulatif banyak lokus kecil. GCTA (Genome-wide Complex Trait Analysis) ialah satu set alatan komputasi untuk menganggar kewarisan dan korelasi genetik daripada data genotip dan fenotip seluruh genom.