Analisis ATAC-seq
ATAC-seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing) ialah satu kaedah untuk memprofilkan landskap kebolehcapaian kromatin di seluruh genom. Dibangunkan oleh Buenrostro dan rakan-rakan pada tahun 2013, ATAC-seq menggunakan transposase yang sangat aktif untuk menandakan kawasan kromatin yang terbuka dan boleh diakses, membolehkan pengenalpastian elemen DNA pengawalaturan yang pantas dan sensitif. ATAC-seq telah menjadi teknik piawai untuk mencirikan landskap pengawalan gen, menemui elemen pengawalaturan khusus jenis sel, dan menyimpulkan rangkaian pengawalan gen.
Baca kaedah sepenuhnya
Log masuk dengan akaun percuma untuk membaca bahagian ini.
Peta kaedah
Kejiranan kaedah berkaitan — pilih satu nod untuk meneroka.
Sumber
- Buenrostro, J. D., Giresi, P. G., Zaba, L. C., Chang, H. Y., & Greenleaf, W. J. (2013). Transposition of native chromatin for fast and sensitive epigenomic profiling of cell populations and tissues. Nature Methods, 10(12), 1213–1218. link ↗
- Corces, M. R., Buenrostro, J. D., Wu, B., Greenside, P. G., Chan, S. M., Koenig, J. L., & Greenleaf, W. J. (2017). Lineage-specific and single-cell chromatin accessibility charts human hematopoiesis. Nature Genetics, 48(10), 1193–1203. DOI: 10.1038/ng.3646 ↗
- Satpathy, A. T., Granja, J. M., Yost, K. E., Qi, Y., Meschi, F., McDermott, G. P., & Chang, H. Y. (2019). Massively parallel single-cell chromatin landscapes. Nature Biotechnology, 37(12), 1452–1462. link ↗
Cara memetik halaman ini
ScholarGate. (2026, June 3). ATAC-seq Analysis for Chromatin Accessibility and Regulatory Landscapes. ScholarGate. https://scholargate.app/ms/genetics/atac-seq-analysis
Kaedah yang mana?
Letakkan kaedah ini di sebelah kaedah yang paling rapat dengannya dan baca secara bersebelahan — perpustakaan menyusun buku di atas meja; pilihan terletak pada anda.
- Analisis Hi-CGenetik↔ banding
- Halaju RNAGenetik↔ banding
Dirujuk oleh
Terjumpa masalah pada halaman ini? Laporkan atau cadangkan pembetulan →