Penjajaran Jujukan Bayesian — Penjajaran Probabilistik dengan Kuantifikasi Ketidakpastian

Penjajaran jujukan Bayesian menganggap penjajaran jujukan biologi (DNA, RNA, atau protein) sebagai masalah inferens probabilistik berbanding pengoptimuman deterministik. Daripada mengembalikan satu penjajaran terbaik, ia mengambil sampel daripada taburan posterior ke atas semua penjajaran yang munasabah berdasarkan model penggantian dan prior penalti jurang, dengan itu mengkuantifikasi ketidakpastian penjajaran. Ia amat berharga apabila analisis hiliran seperti inferens filogenetik atau anotasi fungsianal sensitif terhadap ralat penjajaran.