HKA tests
Hudsonas-Kreitmana-Aguades (HKA) tests ir statistiska metode, kas pārbauda neitrālu evolūciju, salīdzinot polimorfisma līmeni populācijas iekšienē un diverģences līmeni starp populācijām vairākos lokusos. Hudsona, Kreitmana un Aguades 1987. gadā izstrādātā metode izmanto principu, ka neitrāli lokusiem vajadzētu parādīt paredzamās attiecības starp polimorfismu un diverģenci. Lokusi, kas atšķiras no šīm attiecībām, ir kandidāti selekcijai. HKA tests ir īpaši noderīgs selekcijas noteikšanai globālās genomu aptaujās, jo tas izmanto relatīvus salīdzinājumus starp lokusiem, nevis prasa ārēju kalibrēšanu.
Lasīt pilno metodes aprakstu
Piesakieties ar bezmaksas kontu, lai lasītu šo sadaļu.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Avoti
- Hudson, R. R., Kreitman, M., & Aguadé, M. (1987). A test of neutral molecular evolution based on nucleotide data. Genetics, 116(1), 153–159. DOI: 10.1093/genetics/116.1.153 ↗
- Wakeley, J., Nielsen, R., Liu-Cordova, S. N., & Ardlie, K. (2012). The discovery of single-nucleotide polymorphisms and inferences about human demographic history. American Journal of Human Genetics, 69(6), 1332–1347. link ↗
- Biswas, S., & Akey, J. M. (2006). Genome-wide scan for selection on derived alleles. Evolutionary Biology, 36(1), 64–79. link ↗
Kā citēt šo lapu
ScholarGate. (2026, June 3). Hudson-Kreitman-Aguade Test for Detecting Selection. ScholarGate. https://scholargate.app/lv/genetics/hka-test
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Koalescences teorijaĢenētika↔ compare
- F-statistika (FST)Ģenētika↔ compare
- McDonald-Kreitman testsĢenētika↔ compare
- Selection Sweep (Tajima's D)Ģenētika↔ compare
Uz to atsaucas
Pamanījāt kļūdu šajā lapā? Ziņojiet vai ierosiniet labojumu →