RNA Velocity
RNA velocity è un metodo computazionale che inferisce lo stato di sviluppo futuro di singole cellule dai dati di single-cell RNA sequencing. Sviluppata da La Manno e colleghi nel 2018, l'analisi RNA velocity misura la direzione e il ritmo delle transizioni dello stato cellulare analizzando il rapporto tra trascritti di mRNA non processati (unspliced) e processati (spliced) all'interno di singole cellule. Ciò consente la predizione di traiettorie cellulari e percorsi di differenziazione senza richiedere campionamento o manipolazione temporale, fornendo intuizioni uniche sulle decisioni di destino cellulare durante lo sviluppo e le malattie.
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Fonti
- La Manno, G., Soldatov, R., Zeisel, A., Braun, E., Hochgerner, H., Petukhov, V., & Merad, M. (2018). RNA velocity of single cells. Nature, 560(7737), 494–498. DOI: 10.1038/s41586-018-0414-6 ↗
- Bergen, V., Lange, M., Peidli, S., Wolf, F. A., & Raj, B. (2020). Generalizing RNA velocity to transient cell states through smoothed differentiation of expected counts. Nature Biotechnology, 38(12), 1408–1417. DOI: 10.1038/s41587-020-0591-3 ↗
- Chen, H., & Albergante, L. (2022). scVelo: RNA velocity at single-cell resolution. bioRxiv. link ↗
Come citare questa pagina
ScholarGate. (2026, June 3). RNA Velocity for Single-Cell Trajectory Inference. ScholarGate. https://scholargate.app/it/genetics/rna-velocity
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