HKA-teszt
A Hudson-Kreitman-Aguade (HKA) teszt egy statisztikai módszer, amely a neutrális evolúciót vizsgálja populáción belüli polimorfizmus és több génkollokációra kiterjedő populációk közötti divergencia szintjének összehasonlításával. A Hudson, Kreitman és Aguade által 1987-ben kifejlesztett teszt azt az elvet használja, hogy a neutrális génkollokációknak meg kell mutatniuk a polimorfizmus és a divergencia közötti elvárt összefüggéseket. Azok a génkollokációk, amelyek eltérnek ezektől az összefüggésektől, a szelekció jelöltjei. Az HKA-teszt különösen hasznos a szelekció kimutatására genom-szintű felmérésekben, mivel a génkollokációk közötti relatív összehasonlításokat használ, nem pedig külső kalibrációt igényel.
A teljes módszer elolvasása
Jelentkezzen be ingyenes fiókkal a szakasz elolvasásához.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Források
- Hudson, R. R., Kreitman, M., & Aguadé, M. (1987). A test of neutral molecular evolution based on nucleotide data. Genetics, 116(1), 153–159. DOI: 10.1093/genetics/116.1.153 ↗
- Wakeley, J., Nielsen, R., Liu-Cordova, S. N., & Ardlie, K. (2012). The discovery of single-nucleotide polymorphisms and inferences about human demographic history. American Journal of Human Genetics, 69(6), 1332–1347. link ↗
- Biswas, S., & Akey, J. M. (2006). Genome-wide scan for selection on derived alleles. Evolutionary Biology, 36(1), 64–79. link ↗
Hogyan hivatkozzon erre az oldalra
ScholarGate. (2026, June 3). Hudson-Kreitman-Aguade Test for Detecting Selection. ScholarGate. https://scholargate.app/hu/genetics/hka-test
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Koaleszcens elméletGenetika↔ compare
- F-statisztikák (FST)Genetika↔ compare
- McDonald-Kreitman TestGenetika↔ compare
- A szelekciós söprés (Tajima D-statisztika)Genetika↔ compare
Hivatkozik rá
Hibát talált ezen az oldalon? Jelentse, vagy javasoljon javítást →