डी नोवो ट्रांसक्रिप्टोम असेंबली (De Novo Transcriptome Assembly)
डी नोवो ट्रांसक्रिप्टोम असेंबली, संदर्भ जीनोम की आवश्यकता के बिना, सीधे अनुक्रमण रीड्स से पूर्ण-लंबाई वाली मैसेंजर आरएनए (mRNA) अनुक्रमों का पुनर्निर्माण करती है। रेगेव (Regev), हास (Haas) और सहयोगियों द्वारा शुरू की गई यह पाइपलाइन गैर-मॉडल जीवों में ट्रांसक्रिप्ट खोज और नवीन आइसोफॉर्म्स, फ्यूजन जीन्स और स्प्लिस वेरिएंट्स का पता लगाने में सक्षम बनाती है।
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स्रोत
- Grabherr, M. G., Haas, B. J., Yassour, M., Levin, J. Z., Thompson, D. A., Amit, I., ... & Regev, A. (2011). Full-length transcriptome assembly from RNA-Seq data without a reference genome. Nature Biotechnology, 29(7), 644-652. DOI: 10.1038/nbt.1883 ↗
- Haas, B. J., Papanicolaou, A., Yassour, M., Grabherr, M., Blood, P. D., Bowden, J., ... & Regev, A. (2013). De novo transcript sequence reconstruction from RNA-seq using the Trinity platform for reference generation and analysis. Nature Protocols, 8(8), 1494-1512. DOI: 10.1038/nprot.2013.084 ↗
- Pertea, M., Pertea, G. M., Antonescu, C. M., Chang, T. C., Mendell, J. T., & Salzberg, S. L. (2015). StringTie enables improved assembly of novel transcripts from RNA-seq data. Nature Biotechnology, 33(3), 290-295. link ↗
इस पृष्ठ का उद्धरण कैसे दें
ScholarGate. (2026, June 3). De Novo RNA-Seq Transcriptome Assembly. ScholarGate. https://scholargate.app/hi/bioinformatics/de-novo-transcriptome-assembly
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