Network-based pathway enrichment analysis
Network-based pathway enrichment analysis integrates molecular interaction networks — protein-protein interactions, signalling graphs, or gene regulatory networks — with omics measurements to identify biological pathways that are coordinately altered in a condition. Unlike classical over-representation or gene-set enrichment approaches that treat pathway genes as independent lists, this family of methods propagates signals across network edges, capturing the topology of interactions and uncovering dysregulated modules that flat-list enrichment would miss.
רשומת מקור
ציטוטים הועתקו מילה במילה מרשומת המקור של המתודה. לא מוסקת כל אימות ברמת הטענה מהם.
- Ideker, T., Ozier, O., Schwikowski, B., & Siegel, A. F. (2002). Discovering regulatory and signalling circuits in molecular interaction networks. Bioinformatics, 18(suppl_1), S233–S240. · URL
- Vaske, C. J., Benz, S. C., Sanborn, J. Z., Earl, D., Szeto, C., Zhu, J., Haussler, D., & Stuart, J. M. (2010). Inference of patient-specific pathway activities from multi-dimensional cancer genomics data using PARADIGM. Bioinformatics, 26(12), i237–i245. · DOI 10.1093/bioinformatics/btq182
טענות מאוצרות
טענות שנשמרו ביומן הראיות, לכל אחת הערכה משלה.
תצוגה זו אינה ממציאה הערכת טענה כאשר ליומן אין אחת.
מתודות קשורות
נוצר מגרף המתודות ומוצג כיחסים שהוצעו על ידי המכונה — לא מוסקת כל טענת ראיה.