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Hi-C Analysis/Preuve
Dossier de preuve de méthode

Hi-C Analysis

Hi-C (High-Chromosome Conformation Capture) is a technique and associated computational methods for mapping the 3D architecture of the genome within cells. Developed by Lieberman-Aiden and Dekker in 2009, Hi-C identifies physical interactions between genomic regions that may be distant in linear sequence but spatially proximal in 3D nuclear space. Hi-C analysis has revealed fundamental principles of genome organization, including the existence of topologically associating domains (TADs), and provides insights into how 3D structure regulates gene expression and DNA replication.

Sources recorded, not reviewed

Dossier source

Citations copiées telles quelles du dossier source de la méthode. Aucune vérification au niveau de la revendication n'en est déduite.

Hi-C Analysis of 3D Genome Organization and Chromatin Interactions
Dossier de méthode taxonomique · process-pipeline / genetics
  • Lieberman-Aiden, E., van Berkum, N. L., Williams, L., Imakaev, M., Ragoczy, T., Telling, A., & Dekker, J. (2009). Comprehensive mapping of long-range interactions reveals folding principles of the human genome. Science, 326(5950), 289–293. · DOI 10.1126/science.1181369
  • Dixon, J. R., Selvaraj, S., Yue, F., Kim, A., Li, Y., Shen, Y., & Ren, B. (2012). Topological domains in mammalian genomes identified by analysis of chromatin interactions. Nature, 485(7398), 376–380. · DOI 10.1038/nature11082
  • Szabo, Q., Bantignies, F., & Cavalli, G. (2019). 3D chromatin architecture. Nature Reviews Molecular Cell Biology, 20(4), 207–220. · URL
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Revendications organisées

Revendications enregistrées dans le registre de preuves, chacune avec sa propre évaluation.

Pas encore de revendications organisées

Cette vue n'invente pas d'évaluation de revendication lorsque le registre n'en contient aucune.

Méthodes apparentées

Généré à partir du graphe de méthodes et présenté comme des relations suggérées par la machine — aucune revendication de preuve n'est déduite.

Same method familyATAC-seq Analysismachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Same method familyRNA Velocitymachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.

Statut de la preuve

Sources recorded, not reviewed

Bibliographic sources are present. Claim-level evidence review has not been performed.

Sources

3 citations enregistrées, copiées du dossier source de la méthode.

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