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GCTA/Preuve
Dossier de preuve de méthode

GCTA

GCTA (Genome-wide Complex Trait Analysis) is a computational toolkit for estimating heritability and genetic correlations from genome-wide genotype and phenotype data. Developed by Yang and Visscher in 2011, GCTA uses genome-wide restricted maximum likelihood (GREML) to partition phenotypic variance into components explained by common SNPs, environmental factors, and residual variation. GCTA has become a standard tool for understanding the proportion of trait variation attributable to genetics across complex diseases and quantitative traits.

Sources recorded, not reviewed

Dossier source

Citations copiées telles quelles du dossier source de la méthode. Aucune vérification au niveau de la revendication n'en est déduite.

Genome-wide Complex Trait Analysis for Heritability Estimation
Dossier de méthode taxonomique · process-pipeline / genetics
  • Yang, J., Lee, S. H., Goddard, M. E., & Visscher, P. M. (2011). GCTA: A tool for genome-wide complex trait analysis. American Journal of Human Genetics, 88(1), 76–82. · DOI 10.1016/j.ajhg.2010.11.011
  • Zhou, X., Stephens, M. (2012). Genome-wide efficient mixed-model analysis for association studies. Nature Genetics, 44(7), 821–824. · DOI 10.1038/ng.2310
  • Pitchford, W. S., & Brown, W. M. (2019). Genomic prediction and selection of genomic variance. Genetics Selection Evolution, 51(1), 53–66. · URL
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Revendications organisées

Revendications enregistrées dans le registre de preuves, chacune avec sa propre évaluation.

Pas encore de revendications organisées

Cette vue n'invente pas d'évaluation de revendication lorsque le registre n'en contient aucune.

Méthodes apparentées

Généré à partir du graphe de méthodes et présenté comme des relations suggérées par la machine — aucune revendication de preuve n'est déduite.

Same method familyF-statistics (FST)machine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Same method familyLD Block Analysismachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Same method familyPolygenic Risk Scoremachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.Taxonomic bucketQTL Mappingmachine-suggested · Relational suggestion, not evidence.

Statut de la preuve

Sources recorded, not reviewed

Bibliographic sources are present. Claim-level evidence review has not been performed.

Sources

3 citations enregistrées, copiées du dossier source de la méthode.

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