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Analyse bayésienne de l'ARN messager de cellule unique par séquençage — Transcriptomique probabiliste

L'analyse bayésienne de l'ARN messager de cellule unique par séquençage applique des modèles génératifs probabilistes aux matrices de comptage clairsemées et surdispersées produites par le séquençage d'ARN de cellule unique. En plaçant des distributions a priori sur des variables biologiques latentes — état cellulaire, effets de lot, dropout — le cadre propage l'incertitude à travers chaque étape d'inférence en aval. Des outils tels que scVI, SCVI-tools et BayesPrism implémentent ce paradigme, permettant un regroupement cellulaire principiel, des tests d'expression différentielle et une intégration de lots qui modélisent explicitement le bruit technique plutôt que de l'ignorer.

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Analyse bayésienne de l'ARN messager de cellule unique par séquençage
Latent Dirichlet Allocat…Régression binomiale nég…Autoencodeur VariationnelGWAS bayésien

Sources

  1. Lopez, R., Regier, J., Cole, M. B., Jordan, M. I., & Yosef, N. (2018). Deep generative modeling for single-cell transcriptomics. Nature Methods, 15(12), 1053-1058. DOI: 10.1038/s41592-018-0229-2
  2. Eraslan, G., Simon, L. M., Mircea, M., Mueller, N. S., & Theis, F. J. (2019). Single-cell RNA-seq denoising using a deep count autoencoder. Nature Communications, 10(1), 390. DOI: 10.1038/s41467-018-07931-2

Comment citer cette page

ScholarGate. (2026, June 3). Bayesian Probabilistic Analysis of Single-Cell RNA Sequencing Data. ScholarGate. https://scholargate.app/fr/bioinformatics/bayesian-single-cell-rna-seq-analysis

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ScholarGateBayesian single-cell RNA-seq analysis (Bayesian Probabilistic Analysis of Single-Cell RNA Sequencing Data). Consulté le 2026-06-15 sur https://scholargate.app/fr/bioinformatics/bayesian-single-cell-rna-seq-analysis · Jeu de données : https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026