RNA Velocity
RNA velocity is a computational method that infers the future developmental state of individual cells from single-cell RNA-sequencing data. Developed by La Manno and colleagues in 2018, RNA velocity analysis measures the direction and pace of cell state transitions by analyzing the ratio of unspliced to spliced mRNA transcripts within individual cells. This enables prediction of cell trajectories and differentiation pathways without requiring temporal sampling or manipulation, providing unique insights into cell fate decisions during development and disease.
Lähdetietue
Sitaatit kopioitu sanatarkasti metodin lähdetietueesta. Niistä ei päätellä väitteiden tasoista varmennusta.
- La Manno, G., Soldatov, R., Zeisel, A., Braun, E., Hochgerner, H., Petukhov, V., & Merad, M. (2018). RNA velocity of single cells. Nature, 560(7737), 494–498. · DOI 10.1038/s41586-018-0414-6
- Bergen, V., Lange, M., Peidli, S., Wolf, F. A., & Raj, B. (2020). Generalizing RNA velocity to transient cell states through smoothed differentiation of expected counts. Nature Biotechnology, 38(12), 1408–1417. · DOI 10.1038/s41587-020-0591-3
- Chen, H., & Albergante, L. (2022). scVelo: RNA velocity at single-cell resolution. bioRxiv. · URL
Kuratoituja väitteitä
Väitteet tallennettu todistusaineiston pääkirjaan, jokaisella oma arviointinsa.
Tämä näkymä ei keksi väitteen arviointia, jos pääkirjassa ei ole sitä.
Liittyvät metodit
Luotu metodigraafista ja näytetään koneen ehdottamina suhteina – väitteitä ei päätellä.