Yksittäissolu-fylogeneettinen analyysi — Linjapuun rekonstruktio yksittäissolutasoisella resoluutiolla
Yksittäissolu-fylogeneettinen analyysi rekonstruoi evolutiivisia tai kehityksellisiä puita yksittäissolujen sekvensointidatasta jäljittäen, miten yksittäiset solut ovat eriytyneet yhteisestä kantasolusta. Hyödyntämällä somaattisia mutaatioita, CRISPR-introduktoituja palkkeja tai kopiolukumuutoksia periytyvinä ominaisuuksina, tämä menetelmä kartoittaa kloonisuhteita kasvaimissa, kehittyvissä kudoksissa tai immuunirepertuaareissa ennennäkemättömällä solutason resoluutiolla.
Lue koko menetelmä
Kirjaudu sisään maksuttomalla tilillä lukeaksesi tämän osion.
Menetelmäkartta
Lähimenetelmien naapurusto — valitse solmu tutkiaksesi.
Lähteet
- Jones, M. G., Khodaverdian, A., Quinn, J. J., Chan, M. M., Hussmann, J. A., Wang, R., Xu, C., Weissman, J. S., & Yosef, N. (2020). Inference of single-cell phylogenies from lineage tracing data using Cassiopeia. Genome Biology, 21(1), 92. DOI: 10.1186/s13059-020-02000-8 ↗
- Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. DOI: 10.1038/nbt.2859 ↗
Näin viittaat tähän sivuun
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Phylogenetic and Lineage Tree Reconstruction. ScholarGate. https://scholargate.app/fi/bioinformatics/single-cell-phylogenetic-analysis
Mikä menetelmä?
Aseta tämä menetelmä lähimpien sukulaistensa rinnalle ja lue niitä yhdessä — kirjasto asettaa teokset pöydälle; valinta on sinun.
- Kopiolukuvaihtelun analyysi – CNV:n havaitseminen ja tulkintaBioinformatiikka↔ vertaa
- Fylogeneettinen analyysiBioinformatiikka↔ vertaa
- Yksittäisen solun RNA-sekvensointi -analyysiBioinformatiikka↔ vertaa
- Varianttien tunnistusBioinformatiikka↔ vertaa
Huomasitko virheen tällä sivulla? Ilmoita siitä tai ehdota korjausta →