Differentiaalinen yksittäissolu-RNA-seq-analyysi (scRNA-seq)

Differentiaalinen yksittäissolu-RNA-seq (scRNA-seq) -analyysi on laskennallinen putki, joka vertaa transkriptomiprofiileja biologisten olosuhteiden – kuten käsitellyn ja käsittelemättömän, sairaan ja terveen tai eri aikapisteiden – välillä yksittäissolutasolla. Se tunnistaa, mitkä geenit, solutyypit ja solutilat muuttuvat olosuhteiden välillä, tarjoten mekanistista ymmärrystä, jota kokonais-RNA-seq-vertailut eivät voi tarjota. Lähestymistapa yhdistää klusteroinnin, solutyyppien annotoinnin ja tilastollisen testauksen, käyttäen tyypillisesti pseudobulk-aggregaatiota otosten sisäisen korrelaation huomioimiseksi.