Hi-C Analyse
Hi-C (High-Chromosome Conformation Capture) er en teknik og tilhørende beregningsmetoder til at kortlægge genomet i 3D-arkitektur inden i celler. Udviklet af Lieberman-Aiden og Dekker i 2009, identificerer Hi-C fysiske interaktioner mellem genomiske regioner, der kan være fjerntliggende i lineær sekvens, men rumligt proksimale i 3D nukleært rum. Hi-C-analyse har afdækket grundlæggende principper for genomorganisation, herunder eksistensen af topologisk associerende domæner (TAD'er), og giver indsigt i, hvordan 3D-struktur regulerer genekspression og DNA-replikation.
Læs hele metoden
Log ind med en gratis konto for at læse dette afsnit.
Metodekort
Nabolaget af beslægtede metoder — vælg en knude for at udforske.
Kilder
- Lieberman-Aiden, E., van Berkum, N. L., Williams, L., Imakaev, M., Ragoczy, T., Telling, A., & Dekker, J. (2009). Comprehensive mapping of long-range interactions reveals folding principles of the human genome. Science, 326(5950), 289–293. DOI: 10.1126/science.1181369 ↗
- Dixon, J. R., Selvaraj, S., Yue, F., Kim, A., Li, Y., Shen, Y., & Ren, B. (2012). Topological domains in mammalian genomes identified by analysis of chromatin interactions. Nature, 485(7398), 376–380. DOI: 10.1038/nature11082 ↗
- Szabo, Q., Bantignies, F., & Cavalli, G. (2019). 3D chromatin architecture. Nature Reviews Molecular Cell Biology, 20(4), 207–220. link ↗
Sådan citerer du denne side
ScholarGate. (2026, June 3). Hi-C Analysis of 3D Genome Organization and Chromatin Interactions. ScholarGate. https://scholargate.app/da/genetics/hi-c-analysis
Hvilken metode?
Stil denne metode ved siden af dens nærmeste slægtninge, og læs dem side om side — biblioteket lægger bøgerne på bordet; valget er dit.
- ATAC-seq AnalyseGenetik↔ sammenlign
- RNA-hastighedGenetik↔ sammenlign
Refereret af
Har du fundet en fejl på denne side? Indberet den eller foreslå en rettelse →