PPI-netværkstopologi
Analyse af protein-protein-interaktionsnetværk (PPI-netværk) identificerer og karakteriserer de strukturelle egenskaber ved cellulære interaktionsnetværk. Denne tilgang, der blev banebrydende af Uetz og kolleger gennem storskala "yeast two-hybrid screening", afslører topologiske træk som "hubs", moduler og motiver, der koder for funktionel organisation og sygdomsassociationer.
Læs hele metoden
Log ind med en gratis konto for at læse dette afsnit.
Metodekort
Nabolaget af beslægtede metoder — vælg en knude for at udforske.
Kilder
- Uetz, P., Giot, L., Cagney, G., Mansfield, T. A., Judson, R. S., Knight, J. R., ... & Lomax, J. (2000). A comprehensive analysis of protein-protein interactions in Saccharomyces cerevisiae. Nature, 403(6770), 623-627. DOI: 10.1038/35001009 ↗
- Barabási, A. L. & Oltvai, Z. N. (2004). Network biology: understanding the cell's functional organization. Nature Reviews Genetics, 5(2), 101-113. DOI: 10.1038/nrg1272 ↗
- Szklarczyk, D., Gable, A. L., Lyon, D., Junge, A., Wyder, S., Huerta-Cepas, J., ... & Mering, C. V. (2021). STRING v11: protein-protein association networks with increased coverage, supporting functional discovery in genome-wide experimental datasets. Nucleic Acids Research, 49(D1), D605-D612. link ↗
Sådan citerer du denne side
ScholarGate. (2026, June 3). Protein-Protein Interaction Network Analysis and Topology. ScholarGate. https://scholargate.app/da/bioinformatics/ppi-network-topology
Hvilken metode?
Stil denne metode ved siden af dens nærmeste slægtninge, og læs dem side om side — biblioteket lægger bøgerne på bordet; valget er dit.
- Kryo-EM RekonstruktionBioinformatik↔ sammenlign
- HMMER-profilsøgningBioinformatik↔ sammenlign
- Molekylær dockingBioinformatik↔ sammenlign
Refereret af
Har du fundet en fejl på denne side? Indberet den eller foreslå en rettelse →