অনিশ্চিত তাৎপর্যের ভ্যারিয়েন্ট

অনিশ্চিত তাৎপর্যের একটি ভ্যারিয়েন্ট (VUS) হলো একটি ডিএনএ পরিবর্তন, যার জন্য উপলব্ধ প্রমাণ এটিকে রোগ সৃষ্টিকারী বা নিরীহ কোনটিই বলার জন্য অপর্যাপ্ত। এটি প্রমিত পাঁচ-শ্রেণির শ্রেণিবিন্যাসের মধ্যম স্তর, এবং এটি রোগীর ঝুঁকি সম্পর্কে কোনো আবিষ্কার নয় বরং বর্তমান জ্ঞানের সীমাবদ্ধতা সম্পর্কে একটি বিবৃতি। VUS শ্রেণিবিন্যাসগুলি সাধারণ এবং প্রমাণ জমা হওয়ার সাথে সাথে পুনরায় শ্রেণীবদ্ধ করা যেতে পারে।

Definition

অনিশ্চিত তাৎপর্যের একটি ভ্যারিয়েন্ট হলো একটি সিকোয়েন্স ভ্যারিয়েন্ট যার সংগৃহীত প্রমাণ এটিকে প্যাথোজেনিক বা বিনাইন হিসাবে শ্রেণীবদ্ধ করার জন্য অপর্যাপ্ত, যা এটিকে আরও ডেটা না পাওয়া পর্যন্ত প্রমিত শ্রেণিবিন্যাস কাঠামোর কেন্দ্রীয় স্তরে স্থাপন করে।

Scope

এই বিষয়টি ব্যাখ্যা করে যে কেন অনিশ্চিত বিভাগটি বিদ্যমান, প্যাথোজেনিক এবং বিনাইন কলগুলি থেকে এটি কীভাবে আলাদা, সময়ের সাথে সাথে ভ্যারিয়েন্টগুলি কীভাবে পুনরায় শ্রেণীবদ্ধ হয় এবং VUS ফলাফলগুলি কাউন্সেলিং এবং পরীক্ষাগার রিপোর্টিংয়ের জন্য কী চ্যালেঞ্জ তৈরি করে। এটি VUS-এর উপর ক্লিনিকাল পদক্ষেপের জন্য নিয়ম প্রস্তাব না করে অনিশ্চয়তার ব্যাখ্যামূলক এবং যোগাযোগ সমস্যাগুলি সমাধান করে।

Core questions

• কেন বিনাইন এবং প্যাথোজেনিকের মধ্যে একটি অনিশ্চিত বিভাগ বিদ্যমান?
• কী ধরনের প্রমাণ একটি ভ্যারিয়েন্টকে অনিশ্চিত স্তর থেকে সরিয়ে দেয়?
• VUS কীভাবে এবং কখন পুনরায় শ্রেণীবদ্ধ করা হয়?
• কেন VUS ফলাফলগুলি যোগাযোগ করা চ্যালেঞ্জিং?

Key concepts

• শ্রেণিবিন্যাসের অনিশ্চিত স্তর
• অপর্যাপ্ত বা পরস্পরবিরোধী প্রমাণ
• সময়ের সাথে সাথে পুনঃশ্রেণীবিন্যাস
• প্যাথোজেনিসিটির সম্ভাবনা
• অনিশ্চয়তার যোগাযোগ
• একটি VUS-এর অ-কার্যকারিতা

Mechanisms

একটি ভ্যারিয়েন্টকে অনিশ্চিত হিসাবে শ্রেণীবদ্ধ করা হয় যখন ওজনযুক্ত প্রমাণ (সম্ভাব্য) প্যাথোজেনিক বা (সম্ভাব্য) বিনাইনের জন্য থ্রেশহোল্ডে পৌঁছায় না, অথবা যখন প্রমাণ অভ্যন্তরীণভাবে পরস্পরবিরোধী হয় (রিচার্ডস এট আল।, 2015)। মানদণ্ডের বায়েশিয়ান পুনর্গঠনের অধীনে, অনিশ্চিত স্তরটি প্যাথোজেনিসিটির মধ্যবর্তী পোস্টেরিয়র সম্ভাবনার একটি ব্যান্ডের সাথে মিলে যায়, একটি বিচ্ছিন্ন জৈবিক অবস্থার পরিবর্তে (টাভটিগিয়ান এট আল।, 2018)। যেহেতু শ্রেণিবিন্যাস বর্তমান প্রমাণকে প্রতিফলিত করে, তাই ক্রমবর্ধমান ডেটা, যেমন নতুন জনসংখ্যা ফ্রিকোয়েন্সি তথ্য, কার্যকরী গবেষণা, অতিরিক্ত প্রভাবিত পরিবার, বা পরীক্ষাগার জুড়ে ভাগ করা ব্যাখ্যা, একটি ভ্যারিয়েন্টকে বিনাইন বা প্যাথোজেনিক স্তরে স্থানান্তরিত করতে পারে; কপি-নাম্বার ভ্যারিয়েন্টগুলিও তাদের নিজস্ব মানদণ্ডের অধীনে অনিশ্চিত কলের অধীন (রিগস এট আল।, 2020)।

Clinical relevance

একটি VUS, সংজ্ঞা অনুসারে, ক্লিনিক্যালি কার্যকর হিসাবে প্রতিষ্ঠিত নয়, এবং এটি বোঝা জেনেটিক ফলাফলগুলি অতিরিক্ত বা অবমূল্যায়ন না করে মূল্যায়ন এবং যোগাযোগের জন্য অপরিহার্য। এই বিষয়টি ব্যাখ্যা করে যে একটি অনিশ্চিত শ্রেণিবিন্যাসের অর্থ কী এবং এটি কীভাবে পরিবর্তিত হতে পারে; এটি একটি রেফারেন্স অ্যাকাউন্ট এবং কোনো নির্দিষ্ট ভ্যারিয়েন্টের ক্লিনিকাল ব্যবস্থাপনার নির্দেশ দেয় না।

Epidemiology

ক্লিনিকাল সিকোয়েন্সিংয়ে অনিশ্চিত শ্রেণিবিন্যাসগুলি প্রায়শই ঘটে, বিশেষ করে বিস্তৃত পরীক্ষা এবং বিরল রেফারেন্স ডেটা সহ জিন বা জনসংখ্যার জন্য; একটি নির্দিষ্ট জিনের জন্য সময়ের সাথে সাথে তাদের ফ্রিকোয়েন্সি হ্রাস পেতে থাকে কারণ ভাগ করা প্রমাণ জমা হয় এবং ভ্যারিয়েন্টগুলি পুনরায় শ্রেণীবদ্ধ হয় (রিচার্ডস এট আল।, 2015)।

History

সুনির্দিষ্ট অনিশ্চিত বিভাগটি ACMG/AMP স্কিমের পাঁচ-স্তরের মাঝখানে আনুষ্ঠানিক করা হয়েছিল, যা পরীক্ষাগারগুলিকে এমন ভ্যারিয়েন্টগুলি রিপোর্ট করার একটি সংজ্ঞায়িত উপায় প্রদান করে যা প্রমাণ সমাধান করতে পারেনি (রিচার্ডস এট আল।, 2015)। পরবর্তী বায়েশিয়ান মডেলিং স্পষ্ট করে যে এই স্তরটি একটি নির্দিষ্ট অবস্থার পরিবর্তে একটি মধ্যবর্তী সম্ভাবনাকে প্রতিনিধিত্ব করে এবং থ্রেশহোল্ডগুলি, জীববিজ্ঞান নয়, এটিকে সংলগ্ন স্তরগুলি থেকে পৃথক করে (টাভটিগিয়ান এট আল।, 2018)।

Debates

অনিশ্চিত ব্যান্ডটি কীভাবে সীমাবদ্ধ করা উচিত?

অনিশ্চিতকে সম্ভাব্য বিনাইন এবং সম্ভাব্য প্যাথোজেনিক থেকে পৃথক করে এমন সম্ভাব্যতা থ্রেশহোল্ডগুলি কোথায় সেট করা হবে তা প্রভাবিত করে যে কতগুলি ভ্যারিয়েন্টকে অনিশ্চিত বলা হয়, এবং পরিমাণগত মডেলিং আরও সামঞ্জস্যপূর্ণ সীমানার জন্য যুক্তি দিতে ব্যবহৃত হয়েছে।

Key figures

• Sue Richards
• Heidi Rehm
• Sean Tavtigian

Seminal works

• richards-2015
• tavtigian-2018

Frequently asked questions

অনিশ্চিত তাৎপর্যের একটি ভ্যারিয়েন্ট মানে কি একজন ব্যক্তির রোগ আছে?

না। এর অর্থ হলো প্রমাণ বর্তমানে অপর্যাপ্ত যে ভ্যারিয়েন্টটি ক্ষতিকারক নাকি নিরীহ। এটি জ্ঞানের সীমাবদ্ধতা সম্পর্কে একটি বিবৃতি, একটি প্রতিষ্ঠিত ঝুঁকির আবিষ্কার নয়।

একটি VUS কি পরে শ্রেণিবিন্যাস পরিবর্তন করতে পারে?

হ্যাঁ। নতুন প্রমাণ জমা হওয়ার সাথে সাথে, যেমন জনসংখ্যা ডেটা, কার্যকরী গবেষণা, বা ভাগ করা পরীক্ষাগার ব্যাখ্যা, একটি ভ্যারিয়েন্টকে বিনাইন বা প্যাথোজেনিকের দিকে পুনরায় শ্রেণীবদ্ধ করা যেতে পারে।