Анализ на Hi-C
Hi-C (High-Chromosome Conformation Capture – улавяне на конформацията на хромозомите в три измерения) е техника и свързаните с нея изчислителни методи за картографиране на 3D архитектурата на генома в клетките. Разработена от Lieberman-Aiden и Dekker през 2009 г., Hi-C идентифицира физически взаимодействия между геномни региони, които могат да бъдат отдалечени по линейна последователност, но пространствено близки в 3D ядреното пространство. Анализът на Hi-C разкри фундаментални принципи на геномната организация, включително съществуването на топологично асоциирани домейни (TADs), и предоставя прозрения за това как 3D структурата регулира генната експресия и ДНК репликацията.
Прочетете целия метод
Влезте с безплатен профил, за да прочетете този раздел.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Източници
- Lieberman-Aiden, E., van Berkum, N. L., Williams, L., Imakaev, M., Ragoczy, T., Telling, A., & Dekker, J. (2009). Comprehensive mapping of long-range interactions reveals folding principles of the human genome. Science, 326(5950), 289–293. DOI: 10.1126/science.1181369 ↗
- Dixon, J. R., Selvaraj, S., Yue, F., Kim, A., Li, Y., Shen, Y., & Ren, B. (2012). Topological domains in mammalian genomes identified by analysis of chromatin interactions. Nature, 485(7398), 376–380. DOI: 10.1038/nature11082 ↗
- Szabo, Q., Bantignies, F., & Cavalli, G. (2019). 3D chromatin architecture. Nature Reviews Molecular Cell Biology, 20(4), 207–220. link ↗
Как да цитирате тази страница
ScholarGate. (2026, June 3). Hi-C Analysis of 3D Genome Organization and Chromatin Interactions. ScholarGate. https://scholargate.app/bg/genetics/hi-c-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- ATAC-seq анализГенетика↔ compare
- Скорост на РНКГенетика↔ compare
Цитиран в
Забелязахте ли проблем на тази страница? Съобщете или предложете поправка →