Network-based pathway enrichment analysis
Network-based pathway enrichment analysis integrates molecular interaction networks — protein-protein interactions, signalling graphs, or gene regulatory networks — with omics measurements to identify biological pathways that are coordinately altered in a condition. Unlike classical over-representation or gene-set enrichment approaches that treat pathway genes as independent lists, this family of methods propagates signals across network edges, capturing the topology of interactions and uncovering dysregulated modules that flat-list enrichment would miss.
Изходен запис
Цитиранията са копирани дословно от изходния запис на метода. Те не предполагат проверка на ниво твърдение.
- Ideker, T., Ozier, O., Schwikowski, B., & Siegel, A. F. (2002). Discovering regulatory and signalling circuits in molecular interaction networks. Bioinformatics, 18(suppl_1), S233–S240. · URL
- Vaske, C. J., Benz, S. C., Sanborn, J. Z., Earl, D., Szeto, C., Zhu, J., Haussler, D., & Stuart, J. M. (2010). Inference of patient-specific pathway activities from multi-dimensional cancer genomics data using PARADIGM. Bioinformatics, 26(12), i237–i245. · DOI 10.1093/bioinformatics/btq182
Подбрани твърдения
Твърденията са запазени в регистъра на доказателствата, всяко със собствена оценка.
Този изглед не измисля оценка на твърдение, когато регистърът няма такава.
Свързани методи
Генерирани от графа на методите и показани като предложени от машината връзки — не се предполага твърдение за доказателство.