ScholarGate
Trợ lý

So sánh phương pháp

Xem các phương pháp đã chọn cạnh nhau; những hàng khác biệt được làm nổi bật.

Phân tích biểu hiện gen vi sai RNA-seq theo phương pháp Bayes×Phân tích RNA-seq đơn bào×
Lĩnh vựcTin sinh họcTin sinh học
HọProcess / pipelineProcess / pipeline
Năm ra đời2010–20132009 (first scRNA-seq by Tang et al.); widely adopted 2015–2016
Người khởi xướngKendziorski et al. (EBSeq); Hardcastle & Kelly (baySeq)Azim Surani, Barbara Treutlein, and the Regev/McCarroll groups (foundational droplet-based methods ~2015)
LoạiBayesian statistical inference pipelineHigh-throughput single-cell transcriptomic profiling pipeline
Công trình gốcLeng, N., Dawson, J. A., Thomson, J. A., Ruotti, V., Rissman, A. I., Smits, B. M., Haag, J. D., Gould, M. N., Stewart, R. M., & Kendziorski, C. (2013). EBSeq: An empirical Bayes hierarchical model for inference in RNA-seq experiments. Bioinformatics, 29(8), 1035–1043. link ↗Satija, R., Farrell, J. A., Gennert, D., Schier, A. F., & Regev, A. (2015). Spatial reconstruction of single-cell gene expression data. Nature Biotechnology, 33(5), 495–502. DOI ↗
Tên gọi khácBayesian DE analysis, Bayesian RNA-seq DE, baySeq, EBSeqscRNA-seq, single-cell transcriptomics, scRNAseq analysis, single-cell gene expression profiling
Liên quan65
Tóm tắtBayesian RNA-seq differential expression analysis applies hierarchical Bayesian models to RNA sequencing read-count data to identify genes whose expression levels differ significantly between biological conditions. Rather than relying solely on p-values, these methods quantify the posterior probability that a gene is differentially expressed, borrowing statistical strength across genes and naturally accommodating low sample sizes common in genomics experiments.Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) analysis characterises gene expression at the resolution of individual cells, enabling discovery of cell types, states, and transitions that are invisible in bulk transcriptomics. Starting from raw sequencing reads, the workflow produces a cell-by-gene count matrix and proceeds through quality control, normalisation, dimensionality reduction, unsupervised clustering, cell-type annotation, and a range of downstream analyses such as trajectory inference and differential expression between cell populations.
ScholarGateBộ dữ liệu
  1. v1
  2. 2 Nguồn tài liệu
  3. PUBLISHED
  1. v1
  2. 2 Nguồn tài liệu
  3. PUBLISHED

Đến trang tìm kiếm Tải xuống bản trình chiếu

ScholarGateSo sánh phương pháp: Bayesian RNA-seq differential expression · Single-cell RNA-seq analysis. Truy cập ngày 2026-06-17 từ https://scholargate.app/vi/compare