Gọi biến thể theo chuỗi thời gian — Phát hiện đột biến soma dọc theo thời gian

Gọi biến thể theo chuỗi thời gian là một quy trình tin sinh học xác định và theo dõi các biến thể bộ gen — thường là đột biến soma — trên nhiều mẫu giải trình tự được thu thập từ cùng một đối tượng tại các thời điểm khác nhau. Phương pháp này được ứng dụng rộng rãi nhất trong lĩnh vực bộ gen ung thư để tái tạo quá trình tiến hóa của khối u, theo dõi bệnh còn sót lại tối thiểu và phát hiện sự xuất hiện của các dòng tế bào kháng trị liệu. Bằng cách mô hình hóa đồng thời tần suất alen của các biến thể qua chiều thời gian, phương pháp này phân biệt các thay đổi soma thực sự với nhiễu giải trình tự và ước tính động lực học của các dòng tế bào theo thời gian.