Căn chỉnh trình tự đơn bào — Ánh xạ đọc scRNA-seq
Căn chỉnh trình tự đơn bào là bước tính toán ánh xạ hàng triệu đoạn đọc trình tự ngắn được tạo ra bởi các thí nghiệm RNA-seq đơn bào trở lại bộ gen hoặc bộ phiên mã tham chiếu. Không giống như căn chỉnh RNA-seq khối, mỗi đoạn đọc mang một mã vạch tế bào và một Định danh Phân tử Duy nhất (UMI) mà cùng nhau xác định tế bào gốc và phân tử RNA riêng lẻ. Căn chỉnh chính xác và phân tách mã vạch là các điều kiện tiên quyết để xây dựng ma trận đếm tế bào theo gen, vốn là nền tảng cho tất cả các phân tích đơn bào tiếp theo.
Đọc toàn bộ phương pháp
Đăng nhập bằng tài khoản miễn phí để đọc phần này.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Nguồn tài liệu
- Dobin, A., Davis, C. A., Schlesinger, F., Drenkow, J., Zaleski, C., Jha, S., Batut, P., Chaisson, M., & Gingeras, T. R. (2013). STAR: ultrafast universal RNA-seq aligner. Bioinformatics, 29(1), 15–21. DOI: 10.1093/bioinformatics/bts635 ↗
- Smith, T., Heger, A., & Sudbery, I. (2017). UMI-tools: modeling sequencing errors in Unique Molecular Identifiers to improve quantification accuracy. Genome Research, 27(3), 491–499. DOI: 10.1101/gr.209601.116 ↗
Cách trích dẫn trang này
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell RNA-seq Sequence Alignment. ScholarGate. https://scholargate.app/vi/bioinformatics/single-cell-sequence-alignment
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
Compare side by side →Được tham chiếu bởi
Phát hiện lỗi trên trang này? Báo cáo hoặc đề xuất chỉnh sửa →