Тест HKA
Тест Гадсона-Крейтмана-Агуаде (HKA) — це статистичний метод, який перевіряє нейтральну еволюцію шляхом порівняння рівнів поліморфізму в межах популяції та дивергенції між популяціями в численних локусах. Розроблений Гадсоном, Крейтманом та Агуаде у 1987 році, цей тест використовує принцип, згідно з яким нейтральні локуси повинні демонструвати очікувані співвідношення між поліморфізмом та дивергенцією. Локуси, що відхиляються від цих співвідношень, є кандидатами на селекцію. Тест HKA особливо корисний для виявлення селекції в геномних оглядах, оскільки він використовує відносні порівняння між локусами, а не потребує зовнішнього калібрування.
Читати метод повністю
Увійдіть із безкоштовним обліковим записом, щоб прочитати цей розділ.
Карта методів
Околиця споріднених методів — виберіть вузол, щоб дослідити.
Джерела
- Hudson, R. R., Kreitman, M., & Aguadé, M. (1987). A test of neutral molecular evolution based on nucleotide data. Genetics, 116(1), 153–159. DOI: 10.1093/genetics/116.1.153 ↗
- Wakeley, J., Nielsen, R., Liu-Cordova, S. N., & Ardlie, K. (2012). The discovery of single-nucleotide polymorphisms and inferences about human demographic history. American Journal of Human Genetics, 69(6), 1332–1347. link ↗
- Biswas, S., & Akey, J. M. (2006). Genome-wide scan for selection on derived alleles. Evolutionary Biology, 36(1), 64–79. link ↗
Як цитувати цю сторінку
ScholarGate. (2026, June 3). Hudson-Kreitman-Aguade Test for Detecting Selection. ScholarGate. https://scholargate.app/uk/genetics/hka-test
Який метод?
Поставте цей метод поруч із його найближчими спорідненими й читайте їх пліч-о-пліч — бібліотека викладає книги на стіл; вибір за вами.
- Коалесцентна теоріяГенетика↔ порівняти
- F-статистики (FST)Генетика↔ порівняти
- Тест Макдональда-КрейтманаГенетика↔ порівняти
- Selection Sweep (Tajima's D)Генетика↔ порівняти
Згадується в
Помітили помилку на цій сторінці? Повідомте про неї або запропонуйте виправлення →