Botanik Sınıflandırma ve Tanımlama
Botanik sınıflandırma ve tanımlama, farmakognozide kullanılan tıbbi türler de dahil olmak üzere bitkilerin adlandırılması, sınıflandırılması ve doğrulanmasıdır. Doğru botanik kimlik, bitki materyalinin güvenli ve tekrarlanabilir kullanımının temelini oluşturmaktadır; zira yanlış tür veya tağşiş edilmiş (adulterated) bir tür, farklı ve bazen zararlı bileşenler içerebilmektedir.
Tanım
Botanik sınıflandırma ve tanımlama, bitkilerin adlandırılmış, hiyerarşik bir sisteme yerleştirilmesi ve belirli bir bitkinin veya bitki materyalinin kimliğinin morfolojik, mikroskobik, kimyasal ve moleküler yöntemler kullanılarak belirlenmesi ve doğrulanmasıdır.
Kapsam
Bu konu, bitki taksonomisi ve nomenklatürünün (adlandırma) ilkelerini, çiçekli bitkilerin modern filogenetik sınıflandırmasını ve bitki materyalini tanımlamak ve doğrulamak için kullanılan morfolojik, mikroskobik, kimyasal ve moleküler (DNA barkodlama) yöntemleri kapsamaktadır. Bitkilerin nasıl sınıflandırıldığını ve tanımlandığını açıklayan bir referans konu olarak çerçevelenmekte olup, herhangi bir türün seçimi veya kullanımı hakkında bir rehber niteliği taşımamaktadır.
Temel sorular
- Bitkiler nasıl adlandırılmakta ve bir sınıflandırma sistemine nasıl yerleştirilmektedir?
- Tıbbi bitki materyalinin botanik kimliği nasıl belirlenmekte ve doğrulanmaktadır?
- DNA barkodlama gibi moleküler yöntemler bitki tanımlamasında hangi rolü oynamaktadır?
Anahtar kavramlar
- Taksonomik hiyerarşi ve ikili adlandırma (binomial nomenclature)
- Filogenetik sınıflandırma (APG sistemi)
- Morfolojik ve mikroskobik tanımlama
- DNA barkodlama ve moleküler doğrulama
- Tağşiş (adulteration) ve ikame (substitution)
- Voucher örnekleri (voucher specimens) ve doğrulama
Mekanizmalar
Bitkiler iç içe geçmiş bir hiyerarşi (familya, cins, tür) içinde düzenlenmekte ve ikili adlandırma (binomial) ile adlandırılmaktadır; modern çiçekli bitki sınıflandırması, Angiosperm Filogeni Grubu (Angiosperm Phylogeny Group) tarafından özetlenen filogenetik kanıtlara dayanmaktadır. Tıbbi materyalin tanımlanması, teşhis edici özelliklerin makroskobik ve mikroskobik incelenmesini, karakteristik bileşenlerin kimyasal profilini ve kısa standartlaştırılmış genetik bölgeleri referans dizilerle karşılaştıran DNA barkodlama gibi moleküler yöntemleri birleştirmektedir. Bu yaklaşımlar birlikte kimliği doğrulamakta ve tağşişi (adulteration) veya ikameyi (substitution) tespit etmeye yardımcı olmaktadır. Voucher örnekleri (voucher specimens), incelenen materyalin doğrulanabilir bir kaydını muhafaza etmektedir.
Klinik önem
Doğru botanik kimlik, bitkisel materyallerin güvenliği ve tekrarlanabilirliği için bir ön koşuldur, zira yanlış tanımlanmış veya tağşiş edilmiş bitkiler farklı veya toksik bileşenler içerebilmektedir. Bu konu, bitkilerin nasıl sınıflandırıldığını ve doğrulandığını açıklamakta olup, bireysel tanı veya tedavi kararları için bir temel oluşturmamaktadır.
Kanıt ve kılavuzlar
Angiosperm Filogeni Grubu sınıflandırması (APG IV), çiçekli bitki familyaları ve takımları için yaygın olarak kullanılan filogenetik çerçeveyi sağlamaktadır. CBOL Bitki Çalışma Grubu (CBOL Plant Working Group), karasal bitkiler için standart DNA barkod bölgeleri önermiştir. DSÖ (WHO) kalite kontrol yöntemleri ve farmakope monografları, bitkisel materyallerin tanımlanması ve doğrulanması için prosedürleri belirlemektedir.
Tarihçe
Bitki sınıflandırması, on sekizinci yüzyılda Linnaeus tarafından ikili adlandırma (binomial nomenclature) ve resmi bir hiyerarşi ile sistemleştirilmiştir. Daha sonraki şemalar evrimsel ilişkileri içermiş ve yirminci yüzyılın sonlarından itibaren moleküler filogenetik, çiçekli bitki sınıflandırmasını yeniden şekillendirerek ardışık Angiosperm Filogeni Grubu sistemlerinde doruğa ulaşmıştır. DNA barkodlama ise bitki materyalini tanımlamak ve doğrulamak için moleküler bir araç eklemiştir.
Tartışmalar
- Hangi belirteçler bitki DNA barkodu olarak en iyi hizmet etmektedir?
- Standart hayvan barkodunun aksine, tek bir bölge tüm karasal bitkileri net bir şekilde ayırt edememektedir; bu nedenle plastid bölgelerinin kombinasyonları önerilmiştir. Belirteçlerin seçimi ve yakın akraba türler için ayırt etme güçleri aktif bir soru olmaya devam etmektedir.
Öne çıkan isimler
- Carl Linnaeus
İlgili konular
Temel eserler
- apg-iv-2016
- cbol-plants-2009
Sıkça sorulan sorular
- Tıbbi bitkiler için doğru botanik tanımlama neden önemlidir?
- Farklı türler veya tağşiş edilmiş materyal, toksik olanlar da dahil olmak üzere farklı kimyasal bileşenler içerebilmektedir. Doğru tanımlama ve doğrulama, amaçlanan bitkinin kullanıldığını ve materyalin iddia edildiği gibi olduğunu sağlamaktadır.
- Bitki tanımlamasında DNA barkodlama nedir?
- DNA barkodlama, bir bitkiyi DNA'sının kısa, standartlaştırılmış bölgelerini referans dizilerle karşılaştırarak tanımlamaktadır. Karasal bitkiler için, tek bir bölge tüm türleri güvenilir bir şekilde ayırt edemediği için plastid bölgelerinin kombinasyonları kullanılmaktadır.