GCTA
GCTA (Genome-wide Complex Trait Analysis) is a computational toolkit for estimating heritability and genetic correlations from genome-wide genotype and phenotype data. Developed by Yang and Visscher in 2011, GCTA uses genome-wide restricted maximum likelihood (GREML) to partition phenotypic variance into components explained by common SNPs, environmental factors, and residual variation. GCTA has become a standard tool for understanding the proportion of trait variation attributable to genetics across complex diseases and quantitative traits.
Källpost
Citat kopierade ordagrant från metodens källpost. Ingen verifiering på källnivå härleds från dem.
- Yang, J., Lee, S. H., Goddard, M. E., & Visscher, P. M. (2011). GCTA: A tool for genome-wide complex trait analysis. American Journal of Human Genetics, 88(1), 76–82. · DOI 10.1016/j.ajhg.2010.11.011
- Zhou, X., Stephens, M. (2012). Genome-wide efficient mixed-model analysis for association studies. Nature Genetics, 44(7), 821–824. · DOI 10.1038/ng.2310
- Pitchford, W. S., & Brown, W. M. (2019). Genomic prediction and selection of genomic variance. Genetics Selection Evolution, 51(1), 53–66. · URL
Kuraterade påståenden
Påståenden lagrade i bevisloggen, var och en med sin egen bedömning.
Denna vy hittar inte på en påståendebedömning när loggen saknar en.
Relaterade metoder
Genererade från metodgrafen och visade som maskinföreslagna relationer – inga bevispåståenden härleds.