Encells-variationsanropning — detektering av mutationer med cellulär upplösning
Encells-variationsanropning är en bioinformatisk pipeline som identifierar DNA-sekvensvariationer — enbasvarianter (SNVs), små insertioner och deletioner, samt kopienummerförändringar — inom enskilda celler snarare än över en bulkvävnadsmix. Genom att lösa upp det mutationslandskapet cell för cell, avslöjar den intratumoral heterogenitet, klonal arkitektur och somatiska mutationsmönster som bulksekvensering döljer. Metoden är central för cancergenomik, utvecklingsbiologi och alla studier där genetisk mångfald mellan celler är den primära frågeställningen.
Läs hela metoden
Logga in med ett kostnadsfritt konto för att läsa avsnittet.
Metodkarta
Närområdet av besläktade metoder — välj en nod för att utforska.
Källor
- Zafar, H., Wang, Y., Nakhleh, L., Navin, N., & Chen, K. (2016). Monovar: single-nucleotide variant detection in single cells. Nature Methods, 13(6), 505–507. DOI: 10.1038/nmeth.3835 ↗
- Singer, J., Ruscheweyh, H. J., Doherr, M. G., Stadler, T., & Althaus, C. L. (2021). Single-nucleotide variant calling in single-cell sequencing data with piccolo. BMC Bioinformatics, 22(1), 333. link ↗
Så citerar du den här sidan
ScholarGate. (2026, June 3). Single-Cell Genomic Variant Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/sv/bioinformatics/single-cell-variant-calling
Vilken metod?
Placera den här metoden bredvid sina närmaste släktingar och läs dem sida vid sida — biblioteket lägger fram böckerna på bordet; valet är ditt.
Jämför sida vid sida →Refereras av
Hittade du ett fel på sidan? Rapportera eller föreslå en rättelse →