Enkelcells fylogenetisk analys — Rekonstruktion av stamträd med upplösning på enkelcellsbasis
Enkelcells fylogenetisk analys rekonstruerar evolutionära eller utvecklingsträd från enkelcellssekvenseringsdata, och spårar hur individuella celler divergerade från en gemensam förfader. Genom att utnyttja somatiska mutationer, CRISPR-introducerade streckkoder eller kopienummerförändringar som ärftliga karaktärer, kartlägger denna metod klonala relationer inom tumörer, utvecklande vävnader eller immunsystemets repertoarer med en oöverträffad cellupplösning.
Läs hela metoden
Logga in med ett kostnadsfritt konto för att läsa avsnittet.
Metodkarta
Närområdet av besläktade metoder — välj en nod för att utforska.
Källor
- Jones, M. G., Khodaverdian, A., Quinn, J. J., Chan, M. M., Hussmann, J. A., Wang, R., Xu, C., Weissman, J. S., & Yosef, N. (2020). Inference of single-cell phylogenies from lineage tracing data using Cassiopeia. Genome Biology, 21(1), 92. DOI: 10.1186/s13059-020-02000-8 ↗
- Trapnell, C., Cacchiarelli, D., Grimsby, J., Pokharel, P., Li, S., Morse, M., Lennon, N. J., Livak, K. J., Mikkelsen, T. S., & Rinn, J. L. (2014). The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells. Nature Biotechnology, 32(4), 381-386. DOI: 10.1038/nbt.2859 ↗
Så citerar du den här sidan
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Phylogenetic and Lineage Tree Reconstruction. ScholarGate. https://scholargate.app/sv/bioinformatics/single-cell-phylogenetic-analysis
Vilken metod?
Placera den här metoden bredvid sina närmaste släktingar och läs dem sida vid sida — biblioteket lägger fram böckerna på bordet; valet är ditt.
- Analys av kopienummervariationer – detektion och tolkning av CNVBioinformatik↔ jämför
- Fylogenetisk analysBioinformatik↔ jämför
- Analys av enkelcells-RNA-sekvenseringBioinformatik↔ jämför
- Variant CallingBioinformatik↔ jämför
Hittade du ett fel på sidan? Rapportera eller föreslå en rättelse →