Rhizosphere Amplicon Analysis — Profilering av rotzonsmikrobiomet

Rhizosphere Amplicon Analysis är en molekylär-ekologisk pipeline som används för att karakterisera de mikrobiella samhällen som bebor den rot-nära jordzonen – rhizosfären – genom sekvensering av riktade markörgener såsom bakteriella 16S rRNA-genen eller den fungala ITS-regionen. Metoden, som är allmänt tillämpad inom agronomi, markekologi och växtpatologi, gör det möjligt för forskare att identifiera vilka mikroorganismer som finns närvarande, hur deras sammansättning skiftar under olika grödor, behandlingar eller markförhållanden, och hur samhällsstrukturen relaterar till växtens hälsa och produktivitet.