ScholarGate
Asistenti
Process / pipelineBioinformatics / omics

Thirrja e Variantëve në Kohë — Zbulimi Longitudinal i Mutacioneve Somatike

Thirrja e variantëve në kohë është një linjë përpunimi bioinformatik që identifikon dhe gjurmon variantët gjenomikë — tipikisht mutacione somatike — nëpër disa mostra sekuencimi të mbledhura nga i njëjti subjekt në pika të ndryshme kohore. Ajo aplikohet më gjerësisht në gjenomikën e kancerit për të rindërtuar evolucionin e tumorit, monitoruar sëmundjen minimale të mbetur dhe zbuluar shfaqjen e klonave rezistente ndaj terapisë. Duke modeluar bashkërisht frekuencat e aleleve të variantëve nëpër dimensionin temporal, metoda dallon ndryshimet e vërteta somatike nga zhurma e sekuencimit dhe vlerëson dinamikën klonale me kalimin e kohës.

Hapeni në MethodMindSë shpejtiVideoSë shpejtiShkarko diapozitivat

Lexoni metodën e plotë

Vetëm për anëtarët

Hyni me një llogari falas për ta lexuar këtë seksion.

Hyni

Harta e metodave

Lagjja e metodave të lidhura — zgjidhni një nyje për të eksploruar.

Thirrja e Variantëve në Kohë
Analiza e shprehjes dife…

Burimet

  1. Nik-Zainal, S., et al. (2012). The life history of 21 breast cancers. Cell, 149(5), 994–1007. link
  2. McMahon, M., et al. (2021). Benchmarking algorithms for clonal evolution analysis using multi-region and longitudinal tumour sequencing data. Briefings in Bioinformatics, 22(3), bbaa163. link

Si ta citoni këtë faqe

ScholarGate. (2026, June 3). Time-series Variant Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/sq/bioinformatics/time-series-variant-calling

Cila metodë?

Vendoseni këtë metodë pranë të afërmeve të saj më të ngushta dhe lexojini krah për krah — biblioteka i shtron librat mbi tryezë; zgjedhja është e juaja.

Krahasoni krah për krah
ScholarGateTime-series variant calling (Time-series Variant Calling). Marrë më 2026-06-15 nga https://scholargate.app/sq/bioinformatics/time-series-variant-calling · Seti i të dhënave: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026