Analiza e pasurimit të grupit të gjeneve në nivel qelizor — scGSEA
Analiza e pasurimit të grupit të gjeneve në nivel qelizor (scGSEA) shtrin GSEA klasike të masës në rezolucionin e qelizave individuale. Në vend që të testohet nëse një grup gjeni është i pasuruar në një krahasim në nivel kampioni, scGSEA i cakton një pikë pasurimi ose aktivitet çdo qelize, duke u mundësuar studiuesve të hartojnë aktivitetin e shtegut nëpër popullata heterogjene qelizore, gjendje qelizore dhe trajektore zhvillimore të kapura në të dhënat e renditjes RNA në nivel qelizor.
Lexoni metodën e plotë
Hyni me një llogari falas për ta lexuar këtë seksion.
Harta e metodave
Lagjja e metodave të lidhura — zgjidhni një nyje për të eksploruar.
Burimet
- Aibar, S., Gonzalez-Blas, C. B., Moerman, T., Huynh-Thu, V. A., Imrichova, H., Hulselmans, G., Rambow, F., Marine, J.-C., Geurts, P., Aerts, J., van den Oord, J., Kalender Atak, Z., Wouters, J., & Aerts, S. (2017). SCENIC: Single-cell regulatory network inference and clustering. Nature Methods, 14(11), 1083-1086. link ↗
- DeTomaso, D., Jones, M. G., Subramaniam, M., Ashuach, T., Ye, C. J., & Yosef, N. (2019). Functional interpretation of single cell similarity maps. Nature Communications, 10(1), 4376. link ↗
Si ta citoni këtë faqe
ScholarGate. (2026, June 3). Single-cell Gene Set Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/sq/bioinformatics/single-cell-gene-set-enrichment-analysis
Cila metodë?
Vendoseni këtë metodë pranë të afërmeve të saj më të ngushta dhe lexojini krah për krah — biblioteka i shtron librat mbi tryezë; zgjedhja është e juaja.
- Analiza e Pasurimit të Grupeve Gjenetike (GSEA)Bioinformatikë↔ krahaso
- Analiza e Pasurimit të ShtigjeveBioinformatikë↔ krahaso
- Analiza e shprehjes diferenciale të RNA-seqBioinformatikë↔ krahaso
- Analiza e RNA-seq me një qelizëBioinformatikë↔ krahaso
- Analiza e shprehjes diferenciale të RNA-seq me një qelizëBioinformatikë↔ krahaso
Cituar nga
Similar methods
Vutë re një problem në këtë faqe? Raportojeni ose sugjeroni një korrigjim →