Analiza e pasurimit të shtigjeve bazuar në rrjet
Analiza e pasurimit të shtigjeve bazuar në rrjet integron rrjetet e ndërveprimit molekular – ndërveprimet proteinë-proteinë, grafet sinjalizuese, ose rrjetet rregullatore të gjeneve – me matje omike për të identifikuar shtigjet biologjike që janë ndryshuar në mënyrë koordinuar në një gjendje të caktuar. Ndryshe nga qasjet klasike të mbitestimimit ose pasurimit të grupeve gjenike që i trajtojnë gjentë e shtigjeve si lista të pavarura, kjo familje metodash përhap sinjale përmes skajeve të rrjetit, duke kapur topologjinë e ndërveprimeve dhe duke zbuluar module të çrregulluara që pasurimi me listë të sheshtë do t'i humbte.
Lexoni metodën e plotë
Hyni me një llogari falas për ta lexuar këtë seksion.
Harta e metodave
Lagjja e metodave të lidhura — zgjidhni një nyje për të eksploruar.
Burimet
- Ideker, T., Ozier, O., Schwikowski, B., & Siegel, A. F. (2002). Discovering regulatory and signalling circuits in molecular interaction networks. Bioinformatics, 18(suppl_1), S233–S240. link ↗
- Vaske, C. J., Benz, S. C., Sanborn, J. Z., Earl, D., Szeto, C., Zhu, J., Haussler, D., & Stuart, J. M. (2010). Inference of patient-specific pathway activities from multi-dimensional cancer genomics data using PARADIGM. Bioinformatics, 26(12), i237–i245. DOI: 10.1093/bioinformatics/btq182 ↗
Si ta citoni këtë faqe
ScholarGate. (2026, June 3). Network-based Pathway Enrichment Analysis. ScholarGate. https://scholargate.app/sq/bioinformatics/network-based-pathway-enrichment-analysis
Cila metodë?
Vendoseni këtë metodë pranë të afërmeve të saj më të ngushta dhe lexojini krah për krah — biblioteka i shtron librat mbi tryezë; zgjedhja është e juaja.
- Analiza e Pasurimit të Grupeve Gjenetike (GSEA)Bioinformatikë↔ krahaso
Cituar nga
Vutë re një problem në këtë faqe? Raportojeni ose sugjeroni një korrigjim →