Тест HKA
Тест Хадсона-Крейтмана-Агуаде (HKA) — это статистический метод для проверки нейтральной эволюции путём сравнения уровней внутрипопуляционного полиморфизма и межпопуляционной дивергенции по множеству локусов. Разработанный Хадсоном, Крейтманом и Агуаде в 1987 году, этот тест использует принцип, согласно которому нейтральные локусы должны демонстрировать ожидаемые взаимосвязи между полиморфизмом и дивергенцией. Локусы, отклоняющиеся от этих взаимосвязей, являются кандидатами на действие отбора. Тест HKA особенно полезен для обнаружения отбора при полногеномных исследованиях, поскольку он использует относительные сравнения между локусами, а не требует внешней калибровки.
Читать метод полностью
Войдите с бесплатным аккаунтом, чтобы прочитать этот раздел.
Карта метода
Окружение родственных методов — выберите узел, чтобы перейти к нему.
Источники
- Hudson, R. R., Kreitman, M., & Aguadé, M. (1987). A test of neutral molecular evolution based on nucleotide data. Genetics, 116(1), 153–159. DOI: 10.1093/genetics/116.1.153 ↗
- Wakeley, J., Nielsen, R., Liu-Cordova, S. N., & Ardlie, K. (2012). The discovery of single-nucleotide polymorphisms and inferences about human demographic history. American Journal of Human Genetics, 69(6), 1332–1347. link ↗
- Biswas, S., & Akey, J. M. (2006). Genome-wide scan for selection on derived alleles. Evolutionary Biology, 36(1), 64–79. link ↗
Как цитировать эту страницу
ScholarGate. (2026, June 3). Hudson-Kreitman-Aguade Test for Detecting Selection. ScholarGate. https://scholargate.app/ru/genetics/hka-test
Какой метод?
Поставьте этот метод рядом с ближайшими родственными и прочитайте их бок о бок — библиотека выкладывает книги на стол, а выбор за вами.
- Коалесцентная теорияГенетика↔ сравнить
- F-статистики (FST)Генетика↔ сравнить
- Тест Макдональда-Крейтмана (MK)Генетика↔ сравнить
- Sweep Selection (Tajima's D)Генетика↔ сравнить
Упоминается в
Нашли ошибку на этой странице? Сообщите о ней или предложите исправление →