Time-series variant calling
Time-series variant calling is a bioinformatics pipeline that identifies and tracks genomic variants — typically somatic mutations — across multiple sequencing samples collected from the same subject at different time points. It is most widely applied in cancer genomics to reconstruct tumour evolution, monitor minimal residual disease, and detect the emergence of therapy-resistant clones. By jointly modelling variant allele frequencies across the temporal dimension, the method distinguishes true somatic changes from sequencing noise and estimates clonal dynamics over time.
Înregistrare sursă
Citările sunt copiate integral din înregistrarea sursă a metodei. Nu se inferă nicio verificare la nivel de afirmație din acestea.
- Nik-Zainal, S., et al. (2012). The life history of 21 breast cancers. Cell, 149(5), 994–1007. · URL
- McMahon, M., et al. (2021). Benchmarking algorithms for clonal evolution analysis using multi-region and longitudinal tumour sequencing data. Briefings in Bioinformatics, 22(3), bbaa163. · URL
Afirmații curate
Afirmațiile sunt stocate în registrul dovezilor, fiecare cu propria evaluare.
Această vizualizare nu inventează o evaluare a afirmației dacă registrul nu conține una.
Metode conexe
Generate din graful metodelor și afișate ca relații sugerate automat — nu se inferă nicio afirmație de dovadă.