Machine learning-assisted pathway enrichment analysis
Machine learning-assisted pathway enrichment analysis integrates classical statistical pathway enrichment methods — such as over-representation analysis or gene set enrichment analysis — with machine learning algorithms to improve sensitivity, handle high-dimensional omics data, and uncover non-linear biological patterns. The approach moves beyond ranking pathways by p-value alone, using ML models to weight gene contributions, distinguish signal from noise across many samples, and prioritize biologically meaningful pathways in complex datasets.
Registro de origem
Citações copiadas literalmente do registro de origem do método. Nenhuma verificação em nível de alegação é inferida delas.
- Chen, E. Y., Tan, C. M., Kou, Y., Duan, Q., Wang, Z., Meirelles, G. V., Clark, N. R., & Ma'ayan, A. (2013). Enrichr: interactive and collaborative HTML5 gene list enrichment analysis tool. BMC Bioinformatics, 14, 128. · URL
- Way, G. P., & Greene, C. S. (2018). Extracting a biologically relevant latent space from cancer transcriptomes with variational autoencoders. Pacific Symposium on Biocomputing, 23, 80–91. · URL
Alegações curadas
Alegações persistidas no livro-razão de evidências, cada uma com sua própria avaliação.
Esta visualização não inventa uma avaliação de alegação quando o livro-razão não a possui.
Métodos relacionados
Gerado a partir do grafo de métodos e mostrado como relações sugeridas por máquina — nenhuma alegação de evidência é inferida.