Test HKA
Test Hudsona-Kreitmana-Aguade (HKA) jest metodą statystyczną służącą do badania neutralnej ewolucji poprzez porównanie poziomu polimorfizmu wewnątrz populacji i dywergencji między populacjami w wielu loci. Opracowany przez Hudsona, Kreitmana i Aguade w 1987 roku, test ten wykorzystuje zasadę, że loci neutralne powinny wykazywać oczekiwane zależności między polimorfizmem a dywergencją. Loci odbiegające od tych zależności są kandydatami na obiekty działania selekcji. Test HKA jest szczególnie użyteczny do wykrywania selekcji w badaniach całego genomu, ponieważ wykorzystuje porównania względne między loci, zamiast wymagać zewnętrznej kalibracji.
Przeczytaj pełny opis metody
Zaloguj się na bezpłatne konto, aby przeczytać tę sekcję.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Źródła
- Hudson, R. R., Kreitman, M., & Aguadé, M. (1987). A test of neutral molecular evolution based on nucleotide data. Genetics, 116(1), 153–159. DOI: 10.1093/genetics/116.1.153 ↗
- Wakeley, J., Nielsen, R., Liu-Cordova, S. N., & Ardlie, K. (2012). The discovery of single-nucleotide polymorphisms and inferences about human demographic history. American Journal of Human Genetics, 69(6), 1332–1347. link ↗
- Biswas, S., & Akey, J. M. (2006). Genome-wide scan for selection on derived alleles. Evolutionary Biology, 36(1), 64–79. link ↗
Jak cytować tę stronę
ScholarGate. (2026, June 3). Hudson-Kreitman-Aguade Test for Detecting Selection. ScholarGate. https://scholargate.app/pl/genetics/hka-test
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Teoria koalescencjiGenetyka↔ compare
- Statystyki F (FST)Genetyka↔ compare
- Test McDonalda-KreitmanaGenetyka↔ compare
- Wybór (D Tajimy)Genetyka↔ compare
Cytowana przez
Widzisz błąd na tej stronie? Zgłoś go lub zaproponuj poprawkę →