Analiza Hi-C
Hi-C (High-Chromosome Conformation Capture) to technika i powiązane z nią metody obliczeniowe służące do mapowania architekturę 3D genomu w komórkach. Opracowana przez Lieberman-Aiden i Dekker w 2009 roku, Hi-C identyfikuje fizyczne interakcje między regionami genomowymi, które mogą być odległe w sekwencji liniowej, ale przestrzenne bliskie w przestrzeni jądrowej 3D. Analiza Hi-C ujawniła fundamentalne zasady organizacji genomu, w tym istnienie domen topologicznie stowarzyszonych (TADs), i dostarcza wglądu w to, jak struktura 3D reguluje ekspresję genów i replikację DNA.
Przeczytaj pełny opis metody
Zaloguj się na bezpłatne konto, aby przeczytać tę sekcję.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Źródła
- Lieberman-Aiden, E., van Berkum, N. L., Williams, L., Imakaev, M., Ragoczy, T., Telling, A., & Dekker, J. (2009). Comprehensive mapping of long-range interactions reveals folding principles of the human genome. Science, 326(5950), 289–293. DOI: 10.1126/science.1181369 ↗
- Dixon, J. R., Selvaraj, S., Yue, F., Kim, A., Li, Y., Shen, Y., & Ren, B. (2012). Topological domains in mammalian genomes identified by analysis of chromatin interactions. Nature, 485(7398), 376–380. DOI: 10.1038/nature11082 ↗
- Szabo, Q., Bantignies, F., & Cavalli, G. (2019). 3D chromatin architecture. Nature Reviews Molecular Cell Biology, 20(4), 207–220. link ↗
Jak cytować tę stronę
ScholarGate. (2026, June 3). Hi-C Analysis of 3D Genome Organization and Chromatin Interactions. ScholarGate. https://scholargate.app/pl/genetics/hi-c-analysis
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- Analiza ATAC-seqGenetyka↔ compare
- Szybkość RNAGenetyka↔ compare
Cytowana przez
Widzisz błąd na tej stronie? Zgłoś go lub zaproponuj poprawkę →