Wariantowe wywoływanie szeregów czasowych — wykrywanie podłużnych mutacji somatycznych

Wariantowe wywoływanie szeregów czasowych to potok bioinformatyczny, który identyfikuje i śledzi warianty genomowe — zazwyczaj mutacje somatyczne — w wielu próbkach sekwencjonowania pobranych od tego samego osobnika w różnych punktach czasowych. Jest on najszerzej stosowany w genomice nowotworów do rekonstrukcji ewolucji guza, monitorowania choroby resztkowej oraz wykrywania pojawiania się klonów opornych na leczenie. Poprzez wspólne modelowanie częstości alleli wariantów w wymiarze czasowym, metoda odróżnia prawdziwe zmiany somatyczne od szumu sekwencjonowania i szacuje dynamikę klonalną w czasie.