Topologia sieci PPI
Analiza sieci interakcji białko-białko identyfikuje i charakteryzuje właściwości strukturalne komórkowych sieci interakcji. Zapoczątkowane przez Uetza i współpracowników poprzez wielkoskalowe przesiewanie metodą dwuhybrydową drożdży, podejście to ujawnia cechy topologiczne, takie jak huby, moduły i motywy, które kodują organizację funkcjonalną i powiązania z chorobami.
Przeczytaj pełny opis metody
Zaloguj się na bezpłatne konto, aby przeczytać tę sekcję.
Mapa metod
Sąsiedztwo pokrewnych metod — wybierz węzeł, aby je zgłębić.
Źródła
- Uetz, P., Giot, L., Cagney, G., Mansfield, T. A., Judson, R. S., Knight, J. R., ... & Lomax, J. (2000). A comprehensive analysis of protein-protein interactions in Saccharomyces cerevisiae. Nature, 403(6770), 623-627. DOI: 10.1038/35001009 ↗
- Barabási, A. L. & Oltvai, Z. N. (2004). Network biology: understanding the cell's functional organization. Nature Reviews Genetics, 5(2), 101-113. DOI: 10.1038/nrg1272 ↗
- Szklarczyk, D., Gable, A. L., Lyon, D., Junge, A., Wyder, S., Huerta-Cepas, J., ... & Mering, C. V. (2021). STRING v11: protein-protein association networks with increased coverage, supporting functional discovery in genome-wide experimental datasets. Nucleic Acids Research, 49(D1), D605-D612. link ↗
Jak cytować tę stronę
ScholarGate. (2026, June 3). Protein-Protein Interaction Network Analysis and Topology. ScholarGate. https://scholargate.app/pl/bioinformatics/ppi-network-topology
Która metoda?
Zestaw tę metodę z najbliższymi jej krewnymi i czytaj je obok siebie — biblioteka kładzie księgi na stole; wybór należy do Ciebie.
- Rekonstrukcja w kriogenicznej mikroskopii elektronowejBioinformatyka↔ porównaj
- Wyszukiwanie profili HMMERBioinformatyka↔ porównaj
- Modelowanie molekularneBioinformatyka↔ porównaj
Cytowana przez
Widzisz błąd na tej stronie? Zgłoś go lub zaproponuj poprawkę →