ScholarGate
Assistent
Process / pipelineBioinformatics / omics

Bayesiaanse analyse van enkele cel RNA-seq — Probabilistische transcriptomica

Bayesiaanse analyse van enkele cel RNA-seq past probabilistische generatieve modellen toe op de schaarse, overmatig verspreide telmatrices die worden geproduceerd door single-cell RNA sequencing. Door prior-verdelingen toe te passen op latente biologische variabelen — celstatus, batch-effecten, dropout — propageert het raamwerk onzekerheid door elke downstream inferentiestap. Hulpmiddelen zoals scVI, SCVI-tools en BayesPrism implementeren dit paradigma, waardoor principiële celclustering, differentiële expressietests en batch-integratie mogelijk zijn die technische ruis expliciet modelleren in plaats van deze te negeren.

Openen in MethodMindBinnenkortVideoBinnenkortDownload slides

Lees de volledige methode

Alleen voor leden

Log in met een gratis account om dit onderdeel te lezen.

Inloggen

Method map

The neighbourhood of related methods — select a node to explore.

Bronnen

  1. Lopez, R., Regier, J., Cole, M. B., Jordan, M. I., & Yosef, N. (2018). Deep generative modeling for single-cell transcriptomics. Nature Methods, 15(12), 1053-1058. DOI: 10.1038/s41592-018-0229-2
  2. Eraslan, G., Simon, L. M., Mircea, M., Mueller, N. S., & Theis, F. J. (2019). Single-cell RNA-seq denoising using a deep count autoencoder. Nature Communications, 10(1), 390. DOI: 10.1038/s41467-018-07931-2

Deze pagina citeren

ScholarGate. (2026, June 3). Bayesian Probabilistic Analysis of Single-Cell RNA Sequencing Data. ScholarGate. https://scholargate.app/nl/bioinformatics/bayesian-single-cell-rna-seq-analysis

Which method?

Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.

Compare side by side

Geciteerd door

ScholarGateBayesian single-cell RNA-seq analysis (Bayesian Probabilistic Analysis of Single-Cell RNA Sequencing Data). Geraadpleegd op 2026-06-15 via https://scholargate.app/nl/bioinformatics/bayesian-single-cell-rna-seq-analysis · Gegevensset: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026