ScholarGate
Pembantu
Process / pipelineBioinformatics / omics

Panggilan Varian Deret Masa — Pengesanan Mutasi Somatik Longitudinal

Panggilan varian deret masa ialah saluran paip bioinformatik yang mengenal pasti dan menjejak varian genomik — lazimnya mutasi somatik — merentasi beberapa sampel jujukan yang dikumpul daripada subjek yang sama pada titik masa yang berbeza. Ia paling meluas digunakan dalam genomik kanser untuk membina semula evolusi tumor, memantau penyakit sisa minimum, dan mengesan kemunculan klon yang tahan terapi. Dengan memodelkan frekuensi alel varian secara bersama merentasi dimensi temporal, kaedah ini membezakan perubahan somatik sebenar daripada hingar jujukan dan menganggarkan dinamik klonal dari semasa ke semasa.

Buka dalam MethodMindTidak lama lagiVideoTidak lama lagiMuat turun slaid

Baca kaedah sepenuhnya

Ahli sahaja

Log masuk dengan akaun percuma untuk membaca bahagian ini.

Log masuk

Peta kaedah

Kejiranan kaedah berkaitan — pilih satu nod untuk meneroka.

Panggilan Varian Deret Masa
Analisis Ungkapan Perbez…

Sumber

  1. Nik-Zainal, S., et al. (2012). The life history of 21 breast cancers. Cell, 149(5), 994–1007. link
  2. McMahon, M., et al. (2021). Benchmarking algorithms for clonal evolution analysis using multi-region and longitudinal tumour sequencing data. Briefings in Bioinformatics, 22(3), bbaa163. link

Cara memetik halaman ini

ScholarGate. (2026, June 3). Time-series Variant Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/ms/bioinformatics/time-series-variant-calling

Kaedah yang mana?

Letakkan kaedah ini di sebelah kaedah yang paling rapat dengannya dan baca secara bersebelahan — perpustakaan menyusun buku di atas meja; pilihan terletak pada anda.

Bandingkan secara bersebelahan
ScholarGateTime-series variant calling (Time-series Variant Calling). Dicapai 2026-06-15 daripada https://scholargate.app/ms/bioinformatics/time-series-variant-calling · Set data: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026