Time-series variant calling
Time-series variant calling is a bioinformatics pipeline that identifies and tracks genomic variants — typically somatic mutations — across multiple sequencing samples collected from the same subject at different time points. It is most widely applied in cancer genomics to reconstruct tumour evolution, monitor minimal residual disease, and detect the emergence of therapy-resistant clones. By jointly modelling variant allele frequencies across the temporal dimension, the method distinguishes true somatic changes from sequencing noise and estimates clonal dynamics over time.
Catatan sumber
Kutipan disalin apa adanya dari catatan sumber metode. Tidak ada verifikasi tingkat klaim yang disimpulkan darinya.
- Nik-Zainal, S., et al. (2012). The life history of 21 breast cancers. Cell, 149(5), 994–1007. · URL
- McMahon, M., et al. (2021). Benchmarking algorithms for clonal evolution analysis using multi-region and longitudinal tumour sequencing data. Briefings in Bioinformatics, 22(3), bbaa163. · URL
Klaim yang dikurasi
Klaim tersimpan dalam buku besar bukti, masing-masing dengan penilaiannya sendiri.
Tampilan ini tidak menciptakan penilaian klaim ketika buku besar tidak memilikinya.
Metode terkait
Dihasilkan dari grafik metode dan ditampilkan sebagai relasi yang disarankan mesin — tidak ada klaim bukti yang disimpulkan.