एंजाइम वर्गीकरण और EC नंबरिंग
एंजाइम वर्गीकरण हजारों ज्ञात एंजाइमों को उनकी संरचना या उत्पत्ति के बजाय उनके द्वारा उत्प्रेरित रासायनिक अभिक्रियाओं के आधार पर व्यवस्थित करता है। एंजाइम कमीशन (EC) नंबरिंग प्रणाली प्रत्येक उत्प्रेरक गतिविधि को चार-भाग वाला नंबर प्रदान करती है, जिससे जीवविज्ञानी और चिकित्सक प्रत्येक विशिष्ट एंजाइम के लिए एक अद्वितीय, भाषा-स्वतंत्र लेबल प्राप्त कर पाते हैं।
Definition
EC नंबरिंग एक पदानुक्रमित वर्गीकरण है, जिसे IUBMB द्वारा बनाए रखा जाता है, जिसमें प्रत्येक एंजाइम गतिविधि को एक चार-भाग वाला नंबर (जैसे EC 1.1.1.1) दिया जाता है जो उसके अभिक्रिया वर्ग, उपवर्ग, उप-उपवर्ग और धारावाहिक पहचानकर्ता को एन्कोड करता है।
Scope
यह प्रविष्टि अभिक्रिया-आधारित वर्गीकरण के सिद्धांत, सात शीर्ष-स्तरीय EC वर्गों और चार-भाग वाले EC नंबर के अर्थ, एक EC नंबर (एक गतिविधि) और एक जीन या प्रोटीन के बीच के अंतर, और इस प्रणाली को बनाए रखने वाले क्यूरेटेड संसाधनों को शामिल करती है। यह एंजाइम नामकरण का एक संदर्भ उपचार है, न कि नैदानिक मार्गदर्शन।
Core questions
- एंजाइमों को किस आधार पर वर्गीकृत किया जाता है?
- सात EC शीर्ष-स्तरीय वर्ग क्या दर्शाते हैं?
- EC कोड में चार संख्याओं में से प्रत्येक का क्या अर्थ है?
- एक EC नंबर किसी विशिष्ट प्रोटीन के बजाय एक गतिविधि का वर्णन क्यों करता है?
Key concepts
- अभिक्रिया-आधारित वर्गीकरण
- चार-भाग वाला EC नंबर
- सात EC वर्ग (ऑक्सीडोरिडक्टेस, ट्रांसफरेसेस, हाइड्रोलेसेस, लाइसेस, आइसोमेरेसेस, लाइगेसेस, ट्रांसलोकेसेस)
- व्यवस्थित बनाम अनुशंसित (तुच्छ) नाम
- गतिविधि बनाम जीन/प्रोटीन पहचान
- क्यूरेटेड नामकरण संसाधन (ENZYME, BRENDA)
Mechanisms
प्रत्येक एंजाइम को उसके द्वारा उत्प्रेरित अभिक्रिया के प्रकार के आधार पर सात शीर्ष-स्तरीय वर्गों में से एक में वर्गीकृत किया जाता है: ऑक्सीडोरिडक्टेस (वर्ग 1), ट्रांसफरेसेस (2), हाइड्रोलेसेस (3), लाइसेस (4), आइसोमेरेसेस (5), लाइगेसेस (6), और ट्रांसलोकेसेस (7, 2018 में जोड़ा गया)। चार-भाग वाला EC नंबर फिर पदानुक्रमित रूप से विवरण को संकीर्ण करता है, पहला अंक वर्ग को दर्शाता है, अगले दो उपवर्ग और उप-उपवर्ग को दर्शाते हैं (आमतौर पर जिस बंधन या समूह पर कार्य किया जाता है), और चौथा विशिष्ट गतिविधि के लिए एक धारावाहिक संख्या है। क्योंकि कोड एक अभिक्रिया का वर्णन करता है, एक ही EC नंबर कई अलग-अलग प्रोटीन या जीनों के अनुरूप हो सकता है, और एक प्रोटीन में एक से अधिक EC नंबर हो सकते हैं। इस प्रणाली को IUBMB द्वारा क्यूरेट और अद्यतन किया जाता है और ENZYME डेटाबेस और BRENDA जैसे संसाधनों के माध्यम से वितरित किया जाता है।
Clinical relevance
EC नंबर डेटाबेस, दवा-लक्ष्य विवरण और चयापचय मार्ग मानचित्रों में एंजाइमों को संदर्भित करने के लिए उपयोग किए जाने वाले मानक पहचानकर्ता प्रदान करते हैं, इसलिए यह प्रणाली इस बात का आधार है कि जैव चिकित्सा में एंजाइम जानकारी कैसे साझा की जाती है। यह प्रविष्टि नामकरण ढांचे की व्याख्या करती है और नैदानिक या उपचार निर्णयों का आधार नहीं है।
Evidence & guidelines
वर्गीकरण को IUBMB की नामकरण समिति की सिफारिशों द्वारा परिभाषित किया गया है और ENZYME और BRENDA सहित क्यूरेटेड डेटाबेस में बनाए रखा गया है, जो EC असाइनमेंट के लिए आधिकारिक संदर्भ के रूप में कार्य करते हैं।
History
बीसवीं सदी के मध्य में असंगत एंजाइम नामों के प्रसार को व्यवस्थित करने के लिए एक अंतरराष्ट्रीय एंजाइम आयोग का गठन किया गया था, और इसने अभिक्रिया-आधारित, चार-भाग वाली नंबरिंग योजना पेश की जिसे IUBMB तब से बनाए हुए है। इस प्रणाली को ENZYME डेटाबेस (Bairoch, 2000) में डिजिटाइज़ किया गया था और BRENDA (Jeske and colleagues, 2019; Chang and colleagues, 2021) जैसे कार्यात्मक संसाधनों द्वारा पूरक किया गया था। 2018 में एक सातवां वर्ग, ट्रांसलोकेसेस, उन एंजाइमों को समायोजित करने के लिए जोड़ा गया था जो झिल्ली के पार गति को उत्प्रेरित करते हैं।
Key figures
- Amos Bairoch
- Dietmar Schomburg
Related topics
Seminal works
- bairoch-2000
- iubmb-recommendations-2013
Frequently asked questions
- EC कोड में चार संख्याओं का क्या अर्थ है?
- पहली संख्या व्यापक अभिक्रिया वर्ग को दर्शाती है, दूसरी और तीसरी इसे उपवर्ग और उप-उपवर्ग तक सीमित करती है (आमतौर पर इसमें शामिल बंधन या रासायनिक समूह), और चौथी विशिष्ट उत्प्रेरित अभिक्रिया की पहचान करने वाली एक धारावाहिक संख्या है।
- क्या एक EC नंबर एक ही जीन या प्रोटीन की पहचान करता है?
- नहीं। एक EC नंबर एक उत्प्रेरक गतिविधि का नाम बताता है, इसलिए वही नंबर कई असंबंधित प्रोटीनों पर लागू हो सकता है, और यदि एक प्रोटीन एक से अधिक अभिक्रियाओं को उत्प्रेरित करता है तो उसमें कई EC नंबर हो सकते हैं।