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Process / pipeline3D genomics

Hi-C विश्लेषण

Hi-C (हाई-क्रोमोसोम कॉन्फॉर्मेशन कैप्चर) कोशिका के भीतर जीनोम की 3D संरचना को मैप करने के लिए एक तकनीक और संबंधित कम्प्यूटेशनल विधियाँ हैं। 2009 में लिबरमैन-एडेन और डेकर द्वारा विकसित, Hi-C उन जीनोमिक क्षेत्रों के बीच भौतिक अंतःक्रियाओं की पहचान करता है जो रैखिक अनुक्रम में दूर हो सकते हैं लेकिन 3D परमाणु स्थान में स्थानिक रूप से निकट होते हैं। Hi-C विश्लेषण ने जीनोम संगठन के मौलिक सिद्धांतों का खुलासा किया है, जिसमें टोपोलॉजिकल रूप से संबद्ध डोमेन (TADs) का अस्तित्व शामिल है, और यह अंतर्दृष्टि प्रदान करता है कि 3D संरचना जीन अभिव्यक्ति और डीएनए प्रतिकृति को कैसे नियंत्रित करती है।

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स्रोत

  1. Lieberman-Aiden, E., van Berkum, N. L., Williams, L., Imakaev, M., Ragoczy, T., Telling, A., & Dekker, J. (2009). Comprehensive mapping of long-range interactions reveals folding principles of the human genome. Science, 326(5950), 289–293. DOI: 10.1126/science.1181369
  2. Dixon, J. R., Selvaraj, S., Yue, F., Kim, A., Li, Y., Shen, Y., & Ren, B. (2012). Topological domains in mammalian genomes identified by analysis of chromatin interactions. Nature, 485(7398), 376–380. DOI: 10.1038/nature11082
  3. Szabo, Q., Bantignies, F., & Cavalli, G. (2019). 3D chromatin architecture. Nature Reviews Molecular Cell Biology, 20(4), 207–220. link

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ScholarGate. (2026, June 3). Hi-C Analysis of 3D Genome Organization and Chromatin Interactions. ScholarGate. https://scholargate.app/hi/genetics/hi-c-analysis

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ScholarGateHi-C Analysis (Hi-C Analysis of 3D Genome Organization and Chromatin Interactions). 2026-06-15 को यहाँ से प्राप्त https://scholargate.app/hi/genetics/hi-c-analysis · डेटासेट: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026