Network-based gene set enrichment analysis
Network-based gene set enrichment analysis (network GSEA) extends classical GSEA by incorporating biological interaction networks — such as protein-protein interaction (PPI) or co-expression graphs — into the enrichment test. Instead of treating each gene independently, the method propagates differential expression signals across network edges, allowing genes that are co-regulated or functionally connected to jointly support the significance of a gene set. The result is a biologically coherent enrichment score that accounts for pathway topology and gene-gene dependencies.
स्रोत रिकॉर्ड
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- Shojaie, A., & Michailidis, G. (2010). Network enrichment analysis in complex experiments. Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology, 9(1), Article 22. · URL
- Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., Paulovich, A., Pomeroy, S. L., Golub, T. R., Lander, E. S., & Mesirov, J. P. (2005). Gene set enrichment analysis: A knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proceedings of the National Academy of Sciences, 102(43), 15545-15550. · URL
क्यूरेटेड दावे
साक्ष्य लेज़र में दावे बने हुए हैं, प्रत्येक का अपना मूल्यांकन है।
जब लेज़र में कोई दावा नहीं होता है तो यह दृश्य दावा मूल्यांकन का आविष्कार नहीं करता है।
संबंधित विधियाँ
विधि ग्राफ़ से उत्पन्न और मशीन-अनुशंसित संबंध के रूप में दिखाए गए हैं — किसी भी साक्ष्य दावे का अनुमान नहीं लगाया गया है।