HKA-testi
Hudsonin, Kreitmanin ja Aguadén (HKA) testi on tilastollinen menetelmä, jolla testataan neutraalia evoluutiota vertaamalla populaation sisäisen polymorfismin ja populaatioiden välisen divergenssin tasoja useissa lokuksissa. Hudsonin, Kreitmanin ja Aguadén vuonna 1987 kehittämä testi perustuu periaatteeseen, että neutraalien lokusten tulisi osoittaa odotettuja suhteita polymorfismin ja divergenssin välillä. Suhteista poikkeavat lokukset ovat ehdokkaita selektiolle. HKA-testi on erityisen hyödyllinen selektion havaitsemisessa koko genomin kattavissa tutkimuksissa, koska se käyttää suhteellisia vertailuja lokusten välillä sen sijaan, että se vaatisi ulkoista kalibrointia.
Lue koko menetelmä
Kirjaudu sisään maksuttomalla tilillä lukeaksesi tämän osion.
Method map
The neighbourhood of related methods — select a node to explore.
Lähteet
- Hudson, R. R., Kreitman, M., & Aguadé, M. (1987). A test of neutral molecular evolution based on nucleotide data. Genetics, 116(1), 153–159. DOI: 10.1093/genetics/116.1.153 ↗
- Wakeley, J., Nielsen, R., Liu-Cordova, S. N., & Ardlie, K. (2012). The discovery of single-nucleotide polymorphisms and inferences about human demographic history. American Journal of Human Genetics, 69(6), 1332–1347. link ↗
- Biswas, S., & Akey, J. M. (2006). Genome-wide scan for selection on derived alleles. Evolutionary Biology, 36(1), 64–79. link ↗
Näin viittaat tähän sivuun
ScholarGate. (2026, June 3). Hudson-Kreitman-Aguade Test for Detecting Selection. ScholarGate. https://scholargate.app/fi/genetics/hka-test
Which method?
Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.
- KoalesenssiteoriaGenetiikka↔ compare
- F-tilastot (FST)Genetiikka↔ compare
- McDonald-Kreitman-testiGenetiikka↔ compare
- Valintalaka (Tajima's D)Genetiikka↔ compare
Tähän viittaavat
Huomasitko virheen tällä sivulla? Ilmoita siitä tai ehdota korjausta →