Bayesiläinen yksittäissolu-RNA-seq-analyysi — Probabilistinen transkriptomiikka

Bayesiläinen yksittäissolu-RNA-seq-analyysi soveltaa probabilistisia generatiivisia malleja yksittäissolu-RNA-sekvensoinnin tuottamiin harvoihin, ylihajontaisiin lukumatriiseihin. Asettamalla priorijakaumat piileville biologisille muuttujille — solutila, erätehosteet, dropout — kehys propagoi epävarmuutta jokaisen jatkoanalyysin vaiheen läpi. Työkalut kuten scVI, SCVI-tools ja BayesPrism toteuttavat tämän paradigman, mahdollistaen periaatteellisen solujen klusteroinnin, differentiaalisen ilmentymisen testauksen ja eräintegraation, jotka mallintavat eksplisiittisesti teknistä kohinaa sen sijaan, että jättäisivät sen huomiotta.