Process / pipelineBioinformatics / omics

فراخوانی واریانت سری زمانی — تشخیص جهش‌های سوماتیک طولی

فراخوانی واریانت سری زمانی یک پایپ‌لاین بیوانفورماتیک است که واریانت‌های ژنومی — معمولاً جهش‌های سوماتیک — را در نمونه‌های توالی‌یابی متعدد جمع‌آوری‌شده از یک فرد در نقاط زمانی مختلف شناسایی و ردیابی می‌کند. این روش عمدتاً در ژنومیک سرطان برای بازسازی تکامل تومور، پایش بیماری باقیمانده حداقل، و تشخیص ظهور کلون‌های مقاوم به درمان به کار می‌رود. با مدل‌سازی مشترک فراوانی آلل واریانت در بعد زمانی، این روش تغییرات سوماتیک واقعی را از نویز توالی‌یابی متمایز کرده و دینامیک کلونال را در طول زمان تخمین می‌زند.

باز کردن در MethodMindبه‌زودیویدیوبه‌زودیDownload slides

مطالعهٔ کامل روش

ویژهٔ اعضا

برای خواندن این بخش با حساب رایگان وارد شوید.

ورود

Method map

The neighbourhood of related methods — select a node to explore.

فراخوانی واریانت سری زمانی
تحلیل بیان افتراقی RNA-s…

منابع

  1. Nik-Zainal, S., et al. (2012). The life history of 21 breast cancers. Cell, 149(5), 994–1007. link
  2. McMahon, M., et al. (2021). Benchmarking algorithms for clonal evolution analysis using multi-region and longitudinal tumour sequencing data. Briefings in Bioinformatics, 22(3), bbaa163. link

نحوهٔ استناد به این صفحه

ScholarGate. (2026, June 3). Time-series Variant Calling. ScholarGate. https://scholargate.app/fa/bioinformatics/time-series-variant-calling

Which method?

Set this method beside its closest kin and read them side by side — the library lays the books on the table; the choice is yours.

Compare side by side
ScholarGateTime-series variant calling (Time-series Variant Calling). بازیابی‌شده در 2026-06-15 از https://scholargate.app/fa/bioinformatics/time-series-variant-calling · مجموعه‌داده: https://doi.org/10.5281/zenodo.20539026